108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0030 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  56.7 
 
 
674 aa  772    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  61.28 
 
 
676 aa  847    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  61.57 
 
 
672 aa  845    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  55.38 
 
 
676 aa  737    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  95.96 
 
 
676 aa  1318    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  60.98 
 
 
676 aa  849    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  100 
 
 
668 aa  1360    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  60.33 
 
 
670 aa  862    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  56.4 
 
 
674 aa  767    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  61.04 
 
 
674 aa  829    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  57.74 
 
 
674 aa  782    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  60.53 
 
 
672 aa  837    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  40.59 
 
 
710 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  40.14 
 
 
710 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  40.45 
 
 
710 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  40.03 
 
 
710 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  40.3 
 
 
717 aa  437  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  37.97 
 
 
724 aa  391  1e-107  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  40.17 
 
 
677 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  40.17 
 
 
677 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  39.7 
 
 
626 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  36.85 
 
 
607 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  31.68 
 
 
700 aa  291  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  31.61 
 
 
689 aa  280  5e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  33.83 
 
 
693 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  30.88 
 
 
706 aa  272  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  32.46 
 
 
717 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  31.14 
 
 
700 aa  264  4e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  30.44 
 
 
694 aa  261  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  31.24 
 
 
696 aa  261  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  32.5 
 
 
686 aa  259  1e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  30.76 
 
 
703 aa  257  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  32.47 
 
 
700 aa  249  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  30.18 
 
 
882 aa  240  6.999999999999999e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  32.83 
 
 
679 aa  240  8e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  31.46 
 
 
695 aa  239  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  32.88 
 
 
682 aa  238  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  30.4 
 
 
688 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  33 
 
 
680 aa  233  6e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  31.87 
 
 
680 aa  229  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  31.73 
 
 
686 aa  221  3e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  31.5 
 
 
791 aa  215  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  30.08 
 
 
667 aa  214  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  30.16 
 
 
811 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  29.04 
 
 
755 aa  209  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  28.05 
 
 
949 aa  207  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  30.12 
 
 
989 aa  205  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  27.9 
 
 
841 aa  204  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  28.92 
 
 
739 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  28.06 
 
 
675 aa  202  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  27.99 
 
 
709 aa  195  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  29.46 
 
 
729 aa  194  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  35.34 
 
 
915 aa  193  8e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  26.94 
 
 
761 aa  193  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  34.36 
 
 
873 aa  191  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  28.95 
 
 
788 aa  188  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  29.68 
 
 
724 aa  185  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  34.28 
 
 
963 aa  184  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  35.86 
 
 
1342 aa  184  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  34.17 
 
 
551 aa  183  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  30.69 
 
 
556 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  27.89 
 
 
932 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  34.44 
 
 
660 aa  181  4.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  30.06 
 
 
795 aa  180  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  28.42 
 
 
796 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  26.8 
 
 
848 aa  176  9e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  33.79 
 
 
458 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  35.43 
 
 
1412 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  28.38 
 
 
717 aa  173  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  28.74 
 
 
618 aa  173  1e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  27.83 
 
 
890 aa  170  8e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  28.81 
 
 
710 aa  169  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  31.04 
 
 
707 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  35.79 
 
 
1064 aa  164  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  31.91 
 
 
847 aa  164  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  34.83 
 
 
1059 aa  162  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  25.11 
 
 
876 aa  160  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  26.75 
 
 
808 aa  159  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  26.27 
 
 
717 aa  156  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  26.99 
 
 
859 aa  154  5e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  25.47 
 
 
487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1640  MCM family DNA replication protein  32.37 
 
 
246 aa  128  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  30.86 
 
 
467 aa  99.8  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  24.2 
 
 
506 aa  62.4  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0221  Mg chelatase-related protein  25.61 
 
 
501 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0183  Mg chelatase-related protein  25.3 
 
 
501 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0200  Mg chelatase-related protein  25.61 
 
 
501 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  24.92 
 
 
509 aa  49.7  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  25.79 
 
 
314 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1502  putative Mg chelatase-like protein  25.22 
 
 
503 aa  48.1  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0158939  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  30.89 
 
 
654 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  22.86 
 
 
509 aa  47.8  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  24.78 
 
 
506 aa  47.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.67 
 
 
622 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.67 
 
 
622 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.67 
 
 
622 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  31.54 
 
 
368 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  23.76 
 
 
517 aa  47  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1689  putative Mg chelatase-like protein  28.65 
 
 
504 aa  46.2  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.769862  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  23.62 
 
 
547 aa  45.8  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>