More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0216 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0161  Mg chelatase, subunit ChlI  73.06 
 
 		 512 aa  700    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  72.09 
 
 		 569 aa  702    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 517 aa  1025    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  75.58 
 
 		 510 aa  758    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  71.78 
 
 		 523 aa  727    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  67.77 
 
 		 549 aa  695    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  73.45 
 
 		 512 aa  704    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.511309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  76.92 
 
 		 517 aa  756    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  72.61 
 
 		 515 aa  736    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  66.02 
 
 		 504 aa  626  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  64.85 
 
 		 534 aa  626  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  60.27 
 
 		 513 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  59.89 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  58.67 
 
 		 510 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  59.25 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  58.87 
 
 		 496 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  61.99 
 
 		 495 aa  555  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  57.72 
 
 		 498 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  54.55 
 
 		 528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  54.55 
 
 		 528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  54.55 
 
 		 528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  54.36 
 
 		 528 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  54.36 
 
 		 528 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  54.36 
 
 		 528 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  54.36 
 
 		 528 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  57.67 
 
 		 529 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2879  Mg chelatase, subunit ChlI  54.68 
 
 		 534 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  53.25 
 
 		 526 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  53.27 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0435  Mg chelatase, subunit ChlI  54.28 
 
 		 538 aa  505  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2254  Mg chelatase-related protein  54.5 
 
 		 534 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.049586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2868  Mg chelatase, subunit ChlI  54.5 
 
 		 534 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169459  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  54.18 
 
 		 485 aa  498  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2785  Mg chelatase, subunit ChlI  54.36 
 
 		 528 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  55.86 
 
 		 497 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2923  Mg chelatase, subunit ChlI  53.56 
 
 		 536 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  53.5 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  53.11 
 
 		 497 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  53.28 
 
 		 504 aa  487  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  53.98 
 
 		 497 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  49.71 
 
 		 530 aa  484  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4192  Mg chelatase-related protein  53.7 
 
 		 529 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0523  Mg chelatase, subunit ChlI  52.66 
 
 		 532 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887064  normal  0.860383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  54.05 
 
 		 498 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  53.58 
 
 		 510 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  52.93 
 
 		 496 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  50.1 
 
 		 520 aa  470  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  50.29 
 
 		 506 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  50.87 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  53.31 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  49.71 
 
 		 506 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  53.11 
 
 		 496 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  47.78 
 
 		 510 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  53.11 
 
 		 501 aa  465  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  50.39 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  48.02 
 
 		 509 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  49.53 
 
 		 516 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  47.2 
 
 		 512 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0640  hypothetical protein  49.03 
 
 		 503 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  52.72 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  48.78 
 
 		 516 aa  458  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  50.49 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0624  hypothetical protein  49.03 
 
 		 503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  48.07 
 
 		 509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  50.49 
 
 		 507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  50.78 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  51.25 
 
 		 507 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  47.68 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0197  Mg chelatase-related protein  51.76 
 
 		 497 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  54.39 
 
 		 525 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  49.42 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  49.61 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  46.33 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  49.52 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  50.1 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  47.49 
 
 		 509 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  50.1 
 
 		 506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  49.81 
 
 		 507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  49.9 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  50.1 
 
 		 499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  46.44 
 
 		 509 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  46.33 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  46.35 
 
 		 511 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3782  Mg chelatase, subunit ChlI  52.69 
 
 		 499 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121114  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  46.42 
 
 		 509 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  45.19 
 
 		 508 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0082  Mg chelatase, subunit ChlI  53 
 
 		 505 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  47.53 
 
 		 511 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  46.62 
 
 		 509 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  48.83 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  49.42 
 
 		 507 aa  438  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  44.4 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  50.48 
 
 		 507 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  49.81 
 
 		 508 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  49.61 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  46.46 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  49.61 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  50.58 
 
 		 508 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  50.77 
 
 		 507 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  48.25 
 
 		 507 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>