More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3624 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4016  Mg chelatase, subunit ChlI  87.2 
 
 		 508 aa  900    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  92.72 
 
 		 508 aa  954    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4042  Mg chelatase, subunit ChlI  87.2 
 
 		 508 aa  904    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  89.39 
 
 		 509 aa  924    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  73.18 
 
 		 506 aa  764    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  75.74 
 
 		 506 aa  785    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4135  Mg chelatase, subunit ChlI  87.2 
 
 		 508 aa  903    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  75.39 
 
 		 507 aa  790    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  75.79 
 
 		 507 aa  783    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 508 aa  1031    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  99.21 
 
 		 508 aa  1024    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  76.97 
 
 		 507 aa  801    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  76.57 
 
 		 506 aa  780    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3940  Mg chelatase, subunit ChlI  87.4 
 
 		 508 aa  902    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  99.21 
 
 		 508 aa  1024    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  77.51 
 
 		 508 aa  780    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  56.78 
 
 		 509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  56.97 
 
 		 508 aa  570  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  57.2 
 
 		 507 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  57.65 
 
 		 508 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  57 
 
 		 507 aa  563  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  57 
 
 		 507 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  55.71 
 
 		 507 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  56.32 
 
 		 509 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  56.14 
 
 		 507 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  57.03 
 
 		 507 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  57.25 
 
 		 508 aa  552  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  57.17 
 
 		 508 aa  555  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  57.03 
 
 		 508 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  55.91 
 
 		 506 aa  549  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  55.12 
 
 		 507 aa  548  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  52.76 
 
 		 506 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  52.95 
 
 		 506 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  52.95 
 
 		 506 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  52.95 
 
 		 506 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  52.76 
 
 		 506 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  51.48 
 
 		 506 aa  521  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  54.79 
 
 		 516 aa  522  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4133  putative ATP-dependent protease  51.48 
 
 		 506 aa  521  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.815544  normal  0.463834 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03644  predicted bifunctional enzyme and transcriptional regulator  51.68 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4209  Mg chelatase, subunit ChlI  51.68 
 
 		 506 aa  520  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03593  hypothetical protein  51.68 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11947  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3983  putative ATP-dependent protease  51.28 
 
 		 506 aa  518  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  51.28 
 
 		 506 aa  519  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4236  putative ATP-dependent protease  51.28 
 
 		 506 aa  518  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250822  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4153  putative ATP-dependent protease  51.28 
 
 		 506 aa  511  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0392  Mg chelatase, subunit ChlI  54.9 
 
 		 504 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  52.17 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  55.11 
 
 		 497 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  55.2 
 
 		 510 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  53.06 
 
 		 504 aa  497  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3653  Mg chelatase, subunit ChlI  52.49 
 
 		 503 aa  497  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  54.56 
 
 		 498 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  53.77 
 
 		 497 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  52.01 
 
 		 496 aa  477  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  51.09 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  51.99 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  52.91 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  51.13 
 
 		 485 aa  465  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  51.5 
 
 		 497 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  50.6 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  49.01 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  49.4 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  48.8 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  52.47 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  52.66 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  48.8 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  50.98 
 
 		 510 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  52.07 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  50.1 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0640  hypothetical protein  47.05 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0624  hypothetical protein  47.05 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0197  Mg chelatase-related protein  52.91 
 
 		 497 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  51 
 
 		 504 aa  438  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  49.42 
 
 		 523 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0082  Mg chelatase, subunit ChlI  52.61 
 
 		 505 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  51.95 
 
 		 569 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  47.12 
 
 		 516 aa  435  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  48.37 
 
 		 526 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  46.82 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  48.13 
 
 		 510 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  52.21 
 
 		 525 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  48.16 
 
 		 530 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  47.73 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  47.73 
 
 		 528 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  50 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  47.21 
 
 		 520 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  47.73 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  47.54 
 
 		 528 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  47.54 
 
 		 528 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  46.77 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  47.54 
 
 		 528 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4192  Mg chelatase-related protein  47.61 
 
 		 529 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  47.54 
 
 		 528 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  49.61 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  47.54 
 
 		 549 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  49.81 
 
 		 517 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  48.63 
 
 		 512 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  44.73 
 
 		 512 aa  425  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2785  Mg chelatase, subunit ChlI  46.74 
 
 		 528 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>