More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0170 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  72.51 
 
 
504 aa  693    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  100 
 
 
534 aa  1045    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  67.25 
 
 
510 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  66.99 
 
 
515 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  64.85 
 
 
517 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  65.39 
 
 
523 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  67.97 
 
 
569 aa  624  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  65.31 
 
 
517 aa  618  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  67.45 
 
 
512 aa  610  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.511309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0161  Mg chelatase, subunit ChlI  67.45 
 
 
512 aa  609  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  61.83 
 
 
549 aa  604  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  62.57 
 
 
512 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  60.12 
 
 
498 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  61.21 
 
 
510 aa  561  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  61.32 
 
 
513 aa  558  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  61.6 
 
 
510 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  58.08 
 
 
496 aa  542  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  60.6 
 
 
495 aa  529  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  60.71 
 
 
529 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  57.28 
 
 
528 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  57.36 
 
 
528 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  55.16 
 
 
505 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  57.28 
 
 
528 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  57.28 
 
 
528 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  57.87 
 
 
528 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  57.28 
 
 
528 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  57.36 
 
 
528 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  57.12 
 
 
526 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  53.86 
 
 
497 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  55.25 
 
 
496 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2879  Mg chelatase, subunit ChlI  56.45 
 
 
534 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2254  Mg chelatase-related protein  56.45 
 
 
534 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.049586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  56.24 
 
 
496 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2868  Mg chelatase, subunit ChlI  56.45 
 
 
534 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  56.18 
 
 
506 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  55.84 
 
 
496 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2785  Mg chelatase, subunit ChlI  56.52 
 
 
528 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  55.46 
 
 
485 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  55.25 
 
 
496 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0435  Mg chelatase, subunit ChlI  56.56 
 
 
538 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4192  Mg chelatase-related protein  56.67 
 
 
529 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  55.47 
 
 
504 aa  478  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2923  Mg chelatase, subunit ChlI  55.68 
 
 
536 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  55.09 
 
 
507 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  51.59 
 
 
508 aa  475  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0523  Mg chelatase, subunit ChlI  56.02 
 
 
532 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887064  normal  0.860383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  54.44 
 
 
497 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  53.27 
 
 
497 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  53.19 
 
 
508 aa  473  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  50.19 
 
 
530 aa  472  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  52.3 
 
 
508 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  54.81 
 
 
498 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  51 
 
 
507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  53.59 
 
 
508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  52.59 
 
 
516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  51.58 
 
 
509 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  51.2 
 
 
507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  53.02 
 
 
510 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  51.9 
 
 
508 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0197  Mg chelatase-related protein  53.74 
 
 
497 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  51.1 
 
 
507 aa  464  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  54.89 
 
 
501 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  52.5 
 
 
507 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  52.3 
 
 
507 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  51.48 
 
 
506 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  52.3 
 
 
507 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  51.39 
 
 
506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  52.19 
 
 
508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  49.9 
 
 
506 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0640  hypothetical protein  49.61 
 
 
503 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4133  putative ATP-dependent protease  49.8 
 
 
506 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.815544  normal  0.463834 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  49.8 
 
 
506 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  50.5 
 
 
506 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  55.88 
 
 
525 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  50.5 
 
 
506 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  50 
 
 
506 aa  451  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  50.5 
 
 
506 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03644  predicted bifunctional enzyme and transcriptional regulator  49.8 
 
 
516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4209  Mg chelatase, subunit ChlI  49.8 
 
 
506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  49.7 
 
 
506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03593  hypothetical protein  49.8 
 
 
516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11947  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  50.69 
 
 
506 aa  448  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  47.74 
 
 
511 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  49.81 
 
 
516 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  52.91 
 
 
499 aa  447  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4236  putative ATP-dependent protease  49.8 
 
 
506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250822  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  51.8 
 
 
501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3983  putative ATP-dependent protease  49.8 
 
 
506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0624  hypothetical protein  49.8 
 
 
503 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  49.9 
 
 
506 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  49.6 
 
 
508 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4153  putative ATP-dependent protease  49.41 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  49.42 
 
 
516 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  47.63 
 
 
509 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  47.12 
 
 
509 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  47.15 
 
 
510 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  48.5 
 
 
513 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  46.53 
 
 
510 aa  438  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  49.11 
 
 
520 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  49 
 
 
507 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>