More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0119 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  64.98 
 
 		 549 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  72.15 
 
 		 569 aa  701    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  72.61 
 
 		 517 aa  728    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  77.52 
 
 		 510 aa  770    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  87.79 
 
 		 523 aa  908    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  72.03 
 
 		 512 aa  688    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.511309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  72.41 
 
 		 517 aa  706    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 515 aa  1025    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0161  Mg chelatase, subunit ChlI  71.84 
 
 		 512 aa  685    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  67.12 
 
 		 504 aa  628  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  66.99 
 
 		 534 aa  620  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  61.1 
 
 		 498 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  60.31 
 
 		 513 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  59.31 
 
 		 510 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  60.84 
 
 		 510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  59.41 
 
 		 496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  59.58 
 
 		 512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  61.89 
 
 		 495 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  55.43 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  55.43 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  55.12 
 
 		 528 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  55.43 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  55.43 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4192  Mg chelatase-related protein  57.17 
 
 		 529 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  54.93 
 
 		 528 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  55.12 
 
 		 528 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  54.95 
 
 		 526 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  55.75 
 
 		 497 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  53.7 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2879  Mg chelatase, subunit ChlI  55.06 
 
 		 534 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0435  Mg chelatase, subunit ChlI  54.48 
 
 		 538 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2254  Mg chelatase-related protein  55.15 
 
 		 534 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.049586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2868  Mg chelatase, subunit ChlI  55.15 
 
 		 534 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169459  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  53.31 
 
 		 497 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  54.51 
 
 		 497 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2785  Mg chelatase, subunit ChlI  55.35 
 
 		 528 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  53.12 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0523  Mg chelatase, subunit ChlI  55.04 
 
 		 532 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887064  normal  0.860383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  53.92 
 
 		 504 aa  488  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2923  Mg chelatase, subunit ChlI  54.71 
 
 		 536 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  53.98 
 
 		 485 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  50.58 
 
 		 530 aa  482  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  53.86 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  52.24 
 
 		 507 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 510 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  54.03 
 
 		 496 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  53.67 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  49.61 
 
 		 509 aa  473  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  53.14 
 
 		 507 aa  472  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  53.33 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  51.27 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  51.65 
 
 		 507 aa  475  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  52.15 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  53.33 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  49.12 
 
 		 510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  54.62 
 
 		 496 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0640  hypothetical protein  49.32 
 
 		 503 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  50.49 
 
 		 508 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  49.9 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  52.34 
 
 		 508 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0624  hypothetical protein  49.32 
 
 		 503 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  50.67 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  52.04 
 
 		 499 aa  462  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  55.38 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  54.03 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  51.26 
 
 		 506 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  51.27 
 
 		 508 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  51.27 
 
 		 506 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  52.22 
 
 		 498 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  51.85 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  47.27 
 
 		 512 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  48.84 
 
 		 509 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  50.39 
 
 		 508 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0082  Mg chelatase, subunit ChlI  56.5 
 
 		 505 aa  458  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0197  Mg chelatase-related protein  52.35 
 
 		 497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  53.24 
 
 		 496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  54.84 
 
 		 525 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  49.11 
 
 		 509 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  49.41 
 
 		 506 aa  448  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  50.29 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  50.29 
 
 		 508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3940  Mg chelatase, subunit ChlI  49.22 
 
 		 508 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4016  Mg chelatase, subunit ChlI  49.02 
 
 		 508 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4042  Mg chelatase, subunit ChlI  48.82 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4135  Mg chelatase, subunit ChlI  48.82 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  50.1 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  49.51 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  48.45 
 
 		 520 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  50.49 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0392  Mg chelatase, subunit ChlI  50.39 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  47.12 
 
 		 509 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  47.4 
 
 		 509 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  48.92 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  48.64 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  48.64 
 
 		 506 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  48.73 
 
 		 506 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  48.44 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  48.53 
 
 		 506 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  48.45 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  49.51 
 
 		 509 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>