More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1395 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  100 
 
 
501 aa  963    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  53.06 
 
 
508 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  54.42 
 
 
513 aa  533  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  55.64 
 
 
509 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  58.91 
 
 
499 aa  523  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  57.23 
 
 
513 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  52.55 
 
 
509 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  52.75 
 
 
510 aa  513  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  52.94 
 
 
508 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  52.98 
 
 
506 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  51.79 
 
 
510 aa  511  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  52.56 
 
 
509 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  50.98 
 
 
512 aa  511  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  53.27 
 
 
509 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  49.5 
 
 
510 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  50.68 
 
 
516 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  51.59 
 
 
509 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  50.6 
 
 
514 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  52.55 
 
 
511 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  47.55 
 
 
509 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  52.19 
 
 
504 aa  494  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  51.1 
 
 
509 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  50.89 
 
 
509 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  48.91 
 
 
512 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  51 
 
 
520 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  50.2 
 
 
509 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 
509 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  50.7 
 
 
509 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  49.6 
 
 
513 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  48.81 
 
 
513 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  46.38 
 
 
512 aa  477  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  51.99 
 
 
507 aa  475  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  47.92 
 
 
512 aa  475  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  56.06 
 
 
514 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  52.08 
 
 
505 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  51.37 
 
 
511 aa  474  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  51.68 
 
 
505 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  45.99 
 
 
511 aa  472  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  50 
 
 
513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  55.31 
 
 
495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  49.9 
 
 
518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  46.48 
 
 
512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  53.59 
 
 
511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  50.8 
 
 
496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  49.03 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  48.5 
 
 
507 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  47.49 
 
 
506 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  48.5 
 
 
506 aa  463  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  51.08 
 
 
512 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  49.71 
 
 
518 aa  464  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  48.41 
 
 
506 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  54.56 
 
 
504 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  51.91 
 
 
509 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  52.12 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  52.89 
 
 
510 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  51.08 
 
 
512 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  52.8 
 
 
504 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  47.9 
 
 
501 aa  458  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  52.85 
 
 
512 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  47.95 
 
 
518 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  47.7 
 
 
501 aa  457  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  50.97 
 
 
517 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  53.66 
 
 
506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  46.32 
 
 
530 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  50.49 
 
 
517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  48.07 
 
 
518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  49.6 
 
 
511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  49.37 
 
 
554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  50.98 
 
 
513 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  52.16 
 
 
512 aa  450  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  48.64 
 
 
510 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  46.28 
 
 
512 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  45.13 
 
 
512 aa  443  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  50.6 
 
 
506 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  48.51 
 
 
498 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  42.94 
 
 
507 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  50.29 
 
 
515 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  44.82 
 
 
506 aa  437  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  51.28 
 
 
512 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.511309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0161  Mg chelatase, subunit ChlI  51.28 
 
 
512 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  49.6 
 
 
505 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  50.2 
 
 
510 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  50.67 
 
 
523 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  48.3 
 
 
505 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  49.41 
 
 
510 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  51.8 
 
 
534 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  43.88 
 
 
504 aa  432  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  45.19 
 
 
509 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  48.9 
 
 
497 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  53.51 
 
 
529 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  49.4 
 
 
497 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5963  Mg chelatase, subunit ChlI  53.71 
 
 
525 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  47.9 
 
 
500 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  48.33 
 
 
516 aa  428  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  50 
 
 
497 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  48.95 
 
 
528 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  48.95 
 
 
528 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  48.95 
 
 
528 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  49.8 
 
 
569 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>