More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4052 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  57.81 
 
 
513 aa  644    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
513 aa  1054    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  67.45 
 
 
512 aa  733    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  62.89 
 
 
514 aa  672    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  77.78 
 
 
513 aa  847    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  71.68 
 
 
512 aa  780    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  62.45 
 
 
512 aa  675    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  76.8 
 
 
512 aa  827    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  62.38 
 
 
511 aa  671    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  61.75 
 
 
512 aa  663    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  58.98 
 
 
513 aa  615  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  53.49 
 
 
513 aa  567  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  52.16 
 
 
509 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  52.54 
 
 
509 aa  558  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  51.56 
 
 
512 aa  558  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  53.63 
 
 
509 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  53.22 
 
 
510 aa  550  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  51.85 
 
 
508 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  50.49 
 
 
510 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  51.87 
 
 
509 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  51.67 
 
 
509 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  51.67 
 
 
509 aa  531  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  52.26 
 
 
508 aa  534  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  51.08 
 
 
509 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  51.28 
 
 
509 aa  530  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  50.59 
 
 
509 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  49.32 
 
 
516 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  48.33 
 
 
510 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  51.35 
 
 
518 aa  511  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  51.09 
 
 
505 aa  511  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  49.21 
 
 
506 aa  510  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  48.04 
 
 
509 aa  509  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  49.9 
 
 
504 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  49.31 
 
 
507 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  49.23 
 
 
518 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  50 
 
 
518 aa  504  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  48.51 
 
 
506 aa  503  1e-141  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  49.81 
 
 
511 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  49.52 
 
 
518 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  49.71 
 
 
509 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  49.32 
 
 
511 aa  494  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  48.64 
 
 
511 aa  491  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  48.51 
 
 
506 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  45.91 
 
 
512 aa  482  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  50.59 
 
 
512 aa  482  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  45.74 
 
 
516 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  49.6 
 
 
501 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  47.47 
 
 
511 aa  481  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  49.51 
 
 
512 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  48.74 
 
 
508 aa  478  1e-133  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  47.83 
 
 
507 aa  476  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  49.27 
 
 
514 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  48.63 
 
 
512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  46.53 
 
 
501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  46.14 
 
 
501 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  47.54 
 
 
509 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  45.15 
 
 
520 aa  463  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  46.26 
 
 
506 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  48.81 
 
 
505 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  47.83 
 
 
499 aa  459  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  42.72 
 
 
509 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  47.36 
 
 
506 aa  456  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  49.48 
 
 
511 aa  456  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  47.83 
 
 
496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  48.42 
 
 
505 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1377  Mg chelatase, subunit ChlI  44.91 
 
 
519 aa  445  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000488427  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  47.06 
 
 
505 aa  443  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  43.54 
 
 
514 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  44.19 
 
 
554 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  47.94 
 
 
504 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  47.75 
 
 
506 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  48.61 
 
 
497 aa  435  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  44.01 
 
 
507 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  46.65 
 
 
504 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  47.22 
 
 
510 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  45.19 
 
 
511 aa  430  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  44.95 
 
 
500 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  42.49 
 
 
504 aa  424  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  47.77 
 
 
485 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  45.28 
 
 
498 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  47.92 
 
 
502 aa  422  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  42.86 
 
 
506 aa  421  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  47.28 
 
 
495 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  44.92 
 
 
510 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5963  Mg chelatase, subunit ChlI  45.79 
 
 
525 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1175  Mg chelatase, subunit ChlI  43.24 
 
 
499 aa  414  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  46.77 
 
 
516 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  47.34 
 
 
497 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  45.29 
 
 
508 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  44.42 
 
 
509 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  45.19 
 
 
510 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  46.23 
 
 
497 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  43.38 
 
 
530 aa  411  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  45.67 
 
 
506 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  44.71 
 
 
512 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  45.58 
 
 
507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  47.13 
 
 
498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  46.44 
 
 
504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  45.1 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  44.77 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>