More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0237 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  65.18 
 
 		 498 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  100 
 
 		 495 aa  981    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  71.2 
 
 		 496 aa  701    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  64.17 
 
 		 510 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  64.95 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  62.16 
 
 		 513 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  61.86 
 
 		 510 aa  593  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  61.17 
 
 		 505 aa  586  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  61.6 
 
 		 517 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  62.48 
 
 		 523 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  61.57 
 
 		 512 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  61.89 
 
 		 515 aa  578  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  62.23 
 
 		 517 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  60.46 
 
 		 526 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  62.4 
 
 		 569 aa  574  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  60.5 
 
 		 528 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  60.5 
 
 		 528 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  60.5 
 
 		 528 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  60.31 
 
 		 528 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  60.31 
 
 		 528 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  60.31 
 
 		 528 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  60.31 
 
 		 528 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  62.34 
 
 		 485 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0523  Mg chelatase, subunit ChlI  60.91 
 
 		 532 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887064  normal  0.860383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  60.93 
 
 		 497 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  60.47 
 
 		 512 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.511309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  62.55 
 
 		 504 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0161  Mg chelatase, subunit ChlI  60.47 
 
 		 512 aa  558  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4192  Mg chelatase-related protein  60.11 
 
 		 529 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  60.48 
 
 		 506 aa  551  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  60.12 
 
 		 504 aa  553  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  65.05 
 
 		 529 aa  554  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2785  Mg chelatase, subunit ChlI  59.66 
 
 		 528 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0435  Mg chelatase, subunit ChlI  58.91 
 
 		 538 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2923  Mg chelatase, subunit ChlI  58.95 
 
 		 536 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  60.04 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  59.03 
 
 		 497 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  58.84 
 
 		 506 aa  541  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  56.35 
 
 		 549 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  58.63 
 
 		 506 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2254  Mg chelatase-related protein  59.17 
 
 		 534 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.049586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2879  Mg chelatase, subunit ChlI  59.17 
 
 		 534 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2868  Mg chelatase, subunit ChlI  59.17 
 
 		 534 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169459  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  61.2 
 
 		 534 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  56.59 
 
 		 497 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  56.83 
 
 		 508 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  59.92 
 
 		 501 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  52.59 
 
 		 509 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  57.61 
 
 		 496 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  57.37 
 
 		 507 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  53.82 
 
 		 508 aa  525  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  53.49 
 
 		 530 aa  523  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  56.25 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  54.75 
 
 		 507 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  54.14 
 
 		 507 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  55.13 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  57.81 
 
 		 496 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  57.61 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  53.61 
 
 		 508 aa  508  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  57.66 
 
 		 496 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  58.01 
 
 		 498 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  53.23 
 
 		 509 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0197  Mg chelatase-related protein  56.43 
 
 		 497 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  52.8 
 
 		 509 aa  504  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  54.14 
 
 		 507 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  53.94 
 
 		 507 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  60.04 
 
 		 525 aa  498  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  53.74 
 
 		 507 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0082  Mg chelatase, subunit ChlI  60.97 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0640  hypothetical protein  50.6 
 
 		 503 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  55.31 
 
 		 501 aa  497  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  49.9 
 
 		 509 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0392  Mg chelatase, subunit ChlI  54.12 
 
 		 504 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  51.72 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  53.02 
 
 		 508 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2393  Mg chelatase, subunit ChlI  54.37 
 
 		 503 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  50.4 
 
 		 508 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0624  hypothetical protein  50.7 
 
 		 503 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  50.97 
 
 		 516 aa  491  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  49.21 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  50.8 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3782  Mg chelatase, subunit ChlI  59.6 
 
 		 499 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121114  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  53.02 
 
 		 508 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  51.21 
 
 		 506 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  49.9 
 
 		 508 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  50.8 
 
 		 508 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03644  predicted bifunctional enzyme and transcriptional regulator  51.21 
 
 		 516 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4209  Mg chelatase, subunit ChlI  51.21 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  51.31 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4236  putative ATP-dependent protease  51.21 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250822  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3983  putative ATP-dependent protease  51.21 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  50.6 
 
 		 508 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  50.4 
 
 		 508 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  51.01 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03593  hypothetical protein  51.21 
 
 		 516 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11947  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4133  putative ATP-dependent protease  50.81 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.815544  normal  0.463834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  50.81 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  50.6 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  50.4 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  51 
 
 		 520 aa  479  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>