More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0672 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  79.73 
 
 		 518 aa  833    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  84.75 
 
 		 518 aa  885    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  74.71 
 
 		 516 aa  801    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 518 aa  1051    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  82.43 
 
 		 518 aa  846    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  53.86 
 
 		 511 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  53.67 
 
 		 512 aa  558  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  54.32 
 
 		 513 aa  558  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  52.42 
 
 		 509 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  53.7 
 
 		 509 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  51.93 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  52.03 
 
 		 510 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  52.72 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  51.82 
 
 		 512 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  50.77 
 
 		 512 aa  530  1e-149  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  54.42 
 
 		 513 aa  528  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  52.51 
 
 		 513 aa  527  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  51.56 
 
 		 508 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  51.95 
 
 		 514 aa  522  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  50.29 
 
 		 509 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  51.06 
 
 		 512 aa  521  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  50.48 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  51.35 
 
 		 513 aa  521  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  51.15 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  50.58 
 
 		 509 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  49.42 
 
 		 509 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  50.19 
 
 		 509 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  50.19 
 
 		 512 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  50.19 
 
 		 509 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  48.64 
 
 		 509 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  48.08 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  49.03 
 
 		 509 aa  504  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  49.13 
 
 		 504 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  50.31 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  49.51 
 
 		 506 aa  497  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  46.5 
 
 		 509 aa  495  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  49.9 
 
 		 511 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  48.26 
 
 		 510 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  47.67 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  47.88 
 
 		 508 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  48.64 
 
 		 505 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  47.1 
 
 		 509 aa  487  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  47.29 
 
 		 520 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  48.82 
 
 		 507 aa  479  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  46.8 
 
 		 511 aa  480  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  48.63 
 
 		 506 aa  477  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  48.07 
 
 		 511 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  49.71 
 
 		 501 aa  474  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  48.13 
 
 		 506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  45.45 
 
 		 506 aa  468  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  46.64 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  47.18 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  47.78 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  48.43 
 
 		 505 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  46.87 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  45.79 
 
 		 507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  46.08 
 
 		 501 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  45.88 
 
 		 501 aa  451  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  48.43 
 
 		 505 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  45.99 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  48.04 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  46.62 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  44.44 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  48.76 
 
 		 511 aa  437  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  45.61 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  47.16 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  45.69 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  45.14 
 
 		 509 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  46.44 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  45.44 
 
 		 504 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  45.72 
 
 		 504 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1377  Mg chelatase, subunit ChlI  41.83 
 
 		 519 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000488427  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  47.32 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  44.92 
 
 		 506 aa  421  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  45.33 
 
 		 506 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  46.32 
 
 		 508 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  46.55 
 
 		 508 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  45.88 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  46.15 
 
 		 508 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  44.79 
 
 		 506 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  44.71 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  45.01 
 
 		 497 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  44.47 
 
 		 508 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  44.9 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  44.92 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  44.93 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  44.93 
 
 		 507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  44.05 
 
 		 530 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  45.1 
 
 		 510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  44.79 
 
 		 508 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  42.83 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  41.9 
 
 		 511 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  44.47 
 
 		 516 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  43.27 
 
 		 507 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  46.29 
 
 		 498 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  44.27 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  45.21 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  42.38 
 
 		 501 aa  400  9.999999999999999e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  44.71 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>