More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0605 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  79.73 
 
 		 518 aa  833    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 518 aa  1048    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  76.83 
 
 		 518 aa  806    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  76.45 
 
 		 516 aa  822    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  87.26 
 
 		 518 aa  895    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  54.25 
 
 		 512 aa  567  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  54.51 
 
 		 513 aa  559  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  53.09 
 
 		 511 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  51.26 
 
 		 510 aa  541  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  52.22 
 
 		 509 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  51.75 
 
 		 509 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  51.74 
 
 		 512 aa  538  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  51.45 
 
 		 512 aa  525  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  54.25 
 
 		 513 aa  527  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  51.75 
 
 		 510 aa  522  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  50.97 
 
 		 509 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  51.05 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  50.48 
 
 		 509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  50 
 
 		 512 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  50.58 
 
 		 508 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  49.23 
 
 		 513 aa  514  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  51.16 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  50.29 
 
 		 514 aa  511  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  49.81 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  49.33 
 
 		 512 aa  511  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 		 513 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  50.82 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  49.42 
 
 		 509 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  49.03 
 
 		 512 aa  502  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  49.13 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  49.03 
 
 		 509 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  49.22 
 
 		 509 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  47.6 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  50 
 
 		 507 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  46.69 
 
 		 509 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  48.83 
 
 		 509 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 		 506 aa  488  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  47.59 
 
 		 509 aa  485  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  49.31 
 
 		 506 aa  485  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  47.57 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  46.12 
 
 		 511 aa  482  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  47.39 
 
 		 508 aa  480  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  48.34 
 
 		 506 aa  480  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  46.33 
 
 		 509 aa  473  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  46.69 
 
 		 509 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  49.51 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  45.45 
 
 		 506 aa  472  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  48.55 
 
 		 511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  48.26 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  46.71 
 
 		 520 aa  465  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  48.16 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  47.06 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  47.25 
 
 		 501 aa  458  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  46.17 
 
 		 511 aa  458  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  46.27 
 
 		 509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  46.99 
 
 		 512 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  46.81 
 
 		 512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  47.67 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  46.82 
 
 		 507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  45.01 
 
 		 507 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  43.93 
 
 		 554 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  45.79 
 
 		 506 aa  436  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  48.97 
 
 		 511 aa  437  1e-121  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  45.75 
 
 		 506 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  46.77 
 
 		 505 aa  438  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  47.41 
 
 		 512 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  46.46 
 
 		 505 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  45.69 
 
 		 504 aa  429  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  46.63 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  46.51 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  45.83 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  43.66 
 
 		 506 aa  420  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1377  Mg chelatase, subunit ChlI  40.87 
 
 		 519 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000488427  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  44.94 
 
 		 500 aa  416  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  45.31 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  45.44 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  45.82 
 
 		 497 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  45.61 
 
 		 510 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1349  Mg chelatase, subunit ChlI  44.83 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4135  Mg chelatase, subunit ChlI  44.16 
 
 		 508 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  46.49 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  42.83 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  43.96 
 
 		 508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  44.02 
 
 		 513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0337  Mg chelatase, subunit ChlI  54.78 
 
 		 390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.293156  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  43.73 
 
 		 500 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  44.36 
 
 		 508 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  44.38 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  44.36 
 
 		 508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4042  Mg chelatase, subunit ChlI  43.96 
 
 		 508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  45.16 
 
 		 512 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  43.53 
 
 		 507 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4016  Mg chelatase, subunit ChlI  43.76 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  45.32 
 
 		 512 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3940  Mg chelatase, subunit ChlI  44.16 
 
 		 508 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  44.36 
 
 		 508 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5963  Mg chelatase, subunit ChlI  46.81 
 
 		 525 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  45.62 
 
 		 496 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  44.93 
 
 		 497 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  43.99 
 
 		 496 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>