More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1523 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
513 aa  1026    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  58.4 
 
 
511 aa  638    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  59.18 
 
 
512 aa  635    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  58.79 
 
 
513 aa  631  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  58.98 
 
 
513 aa  631  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  58.01 
 
 
512 aa  629  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  59.77 
 
 
512 aa  624  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  59.45 
 
 
514 aa  618  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  58.2 
 
 
512 aa  621  1e-176  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  57.31 
 
 
512 aa  612  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  58.35 
 
 
509 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  58.9 
 
 
509 aa  601  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  57.98 
 
 
513 aa  598  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  58.63 
 
 
509 aa  592  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  56.53 
 
 
513 aa  585  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  58.51 
 
 
510 aa  587  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  54.1 
 
 
512 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  58.38 
 
 
508 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  52.63 
 
 
510 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  56.05 
 
 
511 aa  557  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  53.32 
 
 
508 aa  554  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  53.74 
 
 
509 aa  553  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  55.81 
 
 
516 aa  553  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  52.76 
 
 
509 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  53.61 
 
 
511 aa  551  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  53.15 
 
 
509 aa  547  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  55.41 
 
 
518 aa  546  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  52.95 
 
 
509 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  52.76 
 
 
509 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  54.13 
 
 
509 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  51.18 
 
 
509 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  54.25 
 
 
518 aa  535  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  54.42 
 
 
518 aa  535  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  55.56 
 
 
504 aa  534  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  57.23 
 
 
501 aa  534  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  54.71 
 
 
509 aa  532  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  51.08 
 
 
510 aa  533  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  55.21 
 
 
512 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  53.62 
 
 
511 aa  529  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  54.23 
 
 
518 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  51.65 
 
 
516 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  55.36 
 
 
505 aa  519  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  55.15 
 
 
511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  51.09 
 
 
501 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  51.09 
 
 
501 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  56.52 
 
 
514 aa  502  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  51.78 
 
 
506 aa  503  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  54.16 
 
 
512 aa  499  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  52.98 
 
 
499 aa  498  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  51.86 
 
 
520 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  45.6 
 
 
509 aa  495  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  54.13 
 
 
505 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  50.1 
 
 
507 aa  490  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  50.69 
 
 
506 aa  491  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  48.52 
 
 
506 aa  489  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  53.95 
 
 
504 aa  491  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  55.01 
 
 
504 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  51.08 
 
 
512 aa  487  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  47.66 
 
 
512 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  50.2 
 
 
508 aa  486  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  46.34 
 
 
507 aa  483  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  54 
 
 
506 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  53.17 
 
 
496 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  50.1 
 
 
506 aa  480  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  50.49 
 
 
511 aa  481  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  53.53 
 
 
505 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  47.47 
 
 
506 aa  473  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  49.11 
 
 
554 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  52.05 
 
 
509 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  52.37 
 
 
506 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  54.22 
 
 
485 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  52.48 
 
 
505 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  52.05 
 
 
510 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  51.26 
 
 
512 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  48.26 
 
 
507 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1377  Mg chelatase, subunit ChlI  43.93 
 
 
519 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000488427  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  48.82 
 
 
500 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  47.83 
 
 
530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  47.15 
 
 
509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  49.6 
 
 
498 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  50.39 
 
 
513 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  53.31 
 
 
495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  50.39 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  45.38 
 
 
514 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  51.57 
 
 
497 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  43.34 
 
 
504 aa  440  9.999999999999999e-123  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  46.22 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  50.79 
 
 
512 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  50.2 
 
 
497 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  51.38 
 
 
498 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  48.82 
 
 
508 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  49.32 
 
 
510 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  49.12 
 
 
515 aa  438  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  51.2 
 
 
496 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  48.83 
 
 
510 aa  435  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  49.11 
 
 
508 aa  438  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  47.32 
 
 
516 aa  433  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  47.54 
 
 
506 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  47.53 
 
 
506 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  47.74 
 
 
506 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>