More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0452 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  66.47 
 
 		 504 aa  639    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  100 
 
 		 500 aa  989    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0902  Mg chelatase-related protein  67.81 
 
 		 513 aa  630  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  67.94 
 
 		 512 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  67.94 
 
 		 512 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  66.13 
 
 		 509 aa  595  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  64.93 
 
 		 510 aa  589  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  60.76 
 
 		 502 aa  551  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  59.36 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  58.95 
 
 		 502 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  54.69 
 
 		 510 aa  538  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  59.84 
 
 		 512 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  57.77 
 
 		 512 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  56.49 
 
 		 510 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1815  Mg chelatase, subunit ChlI  58.57 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  58.37 
 
 		 512 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  59.16 
 
 		 512 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  58.57 
 
 		 512 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3594  Mg chelatase, subunit ChlI  56.04 
 
 		 516 aa  525  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  59.84 
 
 		 512 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  57.86 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  55.09 
 
 		 510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  54.89 
 
 		 510 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  54.87 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  57.97 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  57.31 
 
 		 502 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1345  Mg chelatase-like protein  50.9 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2048  Mg chelatase-related protein  54.69 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0235921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  60.24 
 
 		 506 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  58.17 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3547  Mg chelatase, subunit ChlI  55.89 
 
 		 532 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  58.07 
 
 		 512 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3583  Mg chelatase, subunit ChlI  55.47 
 
 		 510 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  56.3 
 
 		 510 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  54.46 
 
 		 516 aa  498  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0363  hypothetical protein  54.47 
 
 		 510 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  47.82 
 
 		 502 aa  481  1e-135  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  45.56 
 
 		 506 aa  476  1e-133  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  54.46 
 
 		 503 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3017  Mg chelatase, subunit ChlI  55.11 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0565  Mg chelatase, subunit ChlI  54.85 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.509634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  44.98 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  51.5 
 
 		 499 aa  455  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  46.43 
 
 		 511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  50.39 
 
 		 520 aa  455  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  46.35 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  46.32 
 
 		 509 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  48.82 
 
 		 513 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  47.41 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  47.02 
 
 		 513 aa  441  9.999999999999999e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  44.6 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  46.72 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  45.83 
 
 		 510 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  42.46 
 
 		 509 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  46.03 
 
 		 512 aa  435  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  45.19 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  43.94 
 
 		 512 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  45.94 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  50.91 
 
 		 504 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  44.73 
 
 		 508 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  47.9 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  44.95 
 
 		 513 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  44.64 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  45.26 
 
 		 513 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  45.83 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  48.88 
 
 		 496 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  42.09 
 
 		 510 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 510 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  45.95 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  47.02 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  47.29 
 
 		 505 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  43.9 
 
 		 516 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  43.74 
 
 		 506 aa  415  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  45.53 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  46.84 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  45.53 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  44.27 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  45.73 
 
 		 509 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  45.42 
 
 		 509 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  44.93 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  47.2 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  45.73 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  44.49 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  45.15 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  51.71 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  44.71 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  49.28 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  46.53 
 
 		 511 aa  405  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  49.49 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  47.91 
 
 		 505 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1349  Mg chelatase, subunit ChlI  47.9 
 
 		 501 aa  402  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  45.53 
 
 		 510 aa  405  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  49.49 
 
 		 506 aa  405  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  46.92 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  43.11 
 
 		 512 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  47.44 
 
 		 507 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  46.73 
 
 		 508 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  43.22 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  46.57 
 
 		 498 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  46.91 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>