More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0664 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
512 aa  1011    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  75.1 
 
 
512 aa  729    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  68.55 
 
 
510 aa  696    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  68.75 
 
 
510 aa  678    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3547  Mg chelatase, subunit ChlI  69.09 
 
 
532 aa  671    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  71.29 
 
 
512 aa  712    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  72.46 
 
 
512 aa  725    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  75.15 
 
 
512 aa  722    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  71.68 
 
 
512 aa  689    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  72.46 
 
 
512 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2048  Mg chelatase-related protein  68.95 
 
 
510 aa  679    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0235921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  70.7 
 
 
512 aa  701    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  71.91 
 
 
512 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  71.66 
 
 
510 aa  678    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  75.9 
 
 
512 aa  706    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3583  Mg chelatase, subunit ChlI  70.9 
 
 
510 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  67.77 
 
 
510 aa  683    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  76.1 
 
 
512 aa  723    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1815  Mg chelatase, subunit ChlI  74.16 
 
 
512 aa  717    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0565  Mg chelatase, subunit ChlI  81.35 
 
 
512 aa  754    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.509634  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0363  hypothetical protein  66.21 
 
 
510 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  66.8 
 
 
510 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1345  Mg chelatase-like protein  59.92 
 
 
510 aa  627  1e-178  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3594  Mg chelatase, subunit ChlI  65.09 
 
 
516 aa  617  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  63.55 
 
 
502 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  62.33 
 
 
516 aa  576  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  62.52 
 
 
502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  60.95 
 
 
502 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3017  Mg chelatase, subunit ChlI  61.03 
 
 
509 aa  547  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  62.75 
 
 
506 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  59.68 
 
 
510 aa  530  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  54.87 
 
 
500 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  55.86 
 
 
504 aa  511  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  49.1 
 
 
506 aa  494  9.999999999999999e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  55.05 
 
 
503 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0902  Mg chelatase-related protein  53.29 
 
 
513 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  48.3 
 
 
500 aa  478  1e-133  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  54.69 
 
 
510 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  55.03 
 
 
509 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  55.04 
 
 
512 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  48.13 
 
 
502 aa  464  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  55.04 
 
 
512 aa  465  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  49.42 
 
 
508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  46.85 
 
 
512 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  50.79 
 
 
510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 
520 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  52.15 
 
 
512 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0130  Mg chelatase-related protein  72.3 
 
 
298 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  47.74 
 
 
509 aa  438  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  46.46 
 
 
511 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  49.19 
 
 
496 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  46.85 
 
 
509 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  44.88 
 
 
509 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  45.87 
 
 
509 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  48.3 
 
 
505 aa  428  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  50.79 
 
 
513 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  45.38 
 
 
510 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  48.15 
 
 
510 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  44.66 
 
 
501 aa  422  1e-117  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  46.67 
 
 
513 aa  419  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  50.7 
 
 
504 aa  421  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  49.5 
 
 
501 aa  422  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 
506 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  46.45 
 
 
509 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  46.95 
 
 
509 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  44.69 
 
 
512 aa  418  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  49.8 
 
 
506 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  45.83 
 
 
512 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  46.47 
 
 
513 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  49.9 
 
 
499 aa  415  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  48.61 
 
 
507 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  44.34 
 
 
508 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  49.2 
 
 
485 aa  415  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  49.6 
 
 
497 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  50.2 
 
 
506 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  46.95 
 
 
509 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  44.96 
 
 
512 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  47.63 
 
 
507 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  44.6 
 
 
512 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  49.12 
 
 
505 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  46.23 
 
 
509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  47.3 
 
 
517 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  50.5 
 
 
506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  46.56 
 
 
509 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  44.77 
 
 
513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  44.96 
 
 
513 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  50.81 
 
 
529 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  47.25 
 
 
509 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  50.3 
 
 
501 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  50.71 
 
 
496 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  46.77 
 
 
509 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  47.47 
 
 
511 aa  405  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  48.91 
 
 
504 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1923  magnesium chelatase ChlI subunit  71.81 
 
 
306 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  46.48 
 
 
498 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  47.82 
 
 
495 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  44.29 
 
 
512 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  45.12 
 
 
516 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  48.8 
 
 
497 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  44.4 
 
 
514 aa  399  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>