More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2828 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1001    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0902  Mg chelatase-related protein  71.11 
 
 		 513 aa  682    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  66.47 
 
 		 500 aa  674    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  67.4 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  67 
 
 		 512 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  67.2 
 
 		 512 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  65.26 
 
 		 510 aa  611  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  58.27 
 
 		 512 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  57.48 
 
 		 512 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  59.15 
 
 		 502 aa  558  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  58.57 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3594  Mg chelatase, subunit ChlI  58.81 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  54.78 
 
 		 510 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  57.48 
 
 		 512 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  58.75 
 
 		 502 aa  551  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  58.17 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0363  hypothetical protein  57.68 
 
 		 510 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  57.09 
 
 		 510 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  57.97 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  55.86 
 
 		 512 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  55.18 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1345  Mg chelatase-like protein  51.92 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3583  Mg chelatase, subunit ChlI  57 
 
 		 510 aa  537  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  56.61 
 
 		 512 aa  531  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2048  Mg chelatase-related protein  54.98 
 
 		 510 aa  534  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0235921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  55.98 
 
 		 516 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  57.75 
 
 		 502 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  56.09 
 
 		 510 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  56.36 
 
 		 510 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3547  Mg chelatase, subunit ChlI  56.29 
 
 		 532 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1815  Mg chelatase, subunit ChlI  56.57 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  56.18 
 
 		 512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  56.77 
 
 		 512 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  57.93 
 
 		 510 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  56.37 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3017  Mg chelatase, subunit ChlI  55.95 
 
 		 509 aa  507  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  56.34 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  48.32 
 
 		 502 aa  491  1e-137  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0565  Mg chelatase, subunit ChlI  54.94 
 
 		 512 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.509634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  46.08 
 
 		 506 aa  476  1e-133  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  53.43 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  45.6 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  48.16 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  51.5 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  49.02 
 
 		 520 aa  460  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  47.44 
 
 		 509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  44.88 
 
 		 511 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  46.29 
 
 		 508 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  49.21 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  44.81 
 
 		 512 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  45.19 
 
 		 512 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  44.62 
 
 		 512 aa  440  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  47.91 
 
 		 505 aa  438  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  45.6 
 
 		 501 aa  437  1e-121  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  50.6 
 
 		 504 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  44.51 
 
 		 508 aa  435  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  45.1 
 
 		 513 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  43.33 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  43.5 
 
 		 509 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 510 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  47.84 
 
 		 485 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  45.01 
 
 		 509 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  44.55 
 
 		 510 aa  427  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  44.6 
 
 		 512 aa  426  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  42.52 
 
 		 509 aa  428  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  44.49 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  43.44 
 
 		 513 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  46.38 
 
 		 511 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  47.97 
 
 		 496 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  46 
 
 		 509 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  43.73 
 
 		 513 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  45.31 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  45.38 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  41.49 
 
 		 510 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  44.55 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  42.24 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  43 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  49.5 
 
 		 501 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  44.89 
 
 		 518 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  43.33 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  44.83 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  43.59 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  47.24 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  44.27 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  44.75 
 
 		 506 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  45.13 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  46.31 
 
 		 504 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  47.19 
 
 		 501 aa  411  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  46.88 
 
 		 497 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  44.57 
 
 		 518 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  43.59 
 
 		 509 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  48.76 
 
 		 514 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  42.71 
 
 		 501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  45.67 
 
 		 508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  41.86 
 
 		 516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  47.4 
 
 		 497 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  43.99 
 
 		 518 aa  404  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  42.51 
 
 		 501 aa  403  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  47.55 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  46.72 
 
 		 506 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>