More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0415 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1815  Mg chelatase, subunit ChlI  75.1 
 
 		 512 aa  722    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3547  Mg chelatase, subunit ChlI  68.58 
 
 		 532 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  71.68 
 
 		 512 aa  723    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  66.6 
 
 		 510 aa  658    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  75.49 
 
 		 512 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  74.1 
 
 		 512 aa  690    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  87.7 
 
 		 512 aa  877    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  74.7 
 
 		 510 aa  707    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  67.97 
 
 		 510 aa  697    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  100 
 
 		 512 aa  1001    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  90.04 
 
 		 512 aa  896    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2048  Mg chelatase-related protein  66.6 
 
 		 510 aa  657    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0235921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  96.09 
 
 		 512 aa  949    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3583  Mg chelatase, subunit ChlI  69.92 
 
 		 510 aa  674    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0363  hypothetical protein  66.21 
 
 		 510 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  92.77 
 
 		 512 aa  918    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  87.3 
 
 		 512 aa  843    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  72.92 
 
 		 512 aa  710    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  66.8 
 
 		 510 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  66.21 
 
 		 510 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  76.29 
 
 		 512 aa  721    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0565  Mg chelatase, subunit ChlI  70.32 
 
 		 512 aa  633  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.509634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1345  Mg chelatase-like protein  60.75 
 
 		 510 aa  632  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  67.93 
 
 		 502 aa  632  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  65.14 
 
 		 502 aa  598  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3594  Mg chelatase, subunit ChlI  64.69 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  65.14 
 
 		 502 aa  584  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  62.4 
 
 		 516 aa  560  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  57.97 
 
 		 504 aa  535  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  58.17 
 
 		 500 aa  531  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3017  Mg chelatase, subunit ChlI  59.18 
 
 		 509 aa  530  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0130  Mg chelatase-related protein  86.58 
 
 		 298 aa  525  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  62.85 
 
 		 506 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0902  Mg chelatase-related protein  57.49 
 
 		 513 aa  518  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  57.77 
 
 		 510 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  58.65 
 
 		 509 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  56.43 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  57.14 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  57.46 
 
 		 510 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  47.5 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  47.64 
 
 		 502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  47.31 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  52.96 
 
 		 503 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  46.63 
 
 		 501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  47.47 
 
 		 509 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  48.16 
 
 		 509 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  44.38 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  47.48 
 
 		 509 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  49.61 
 
 		 506 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  49.8 
 
 		 506 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  48.05 
 
 		 510 aa  432  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  50.98 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  50.78 
 
 		 512 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  46.5 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  48.1 
 
 		 496 aa  425  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  43.05 
 
 		 509 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  47.02 
 
 		 509 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  48.68 
 
 		 485 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  48.54 
 
 		 507 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  44.38 
 
 		 508 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  50.69 
 
 		 499 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 510 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  46.63 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  47.81 
 
 		 505 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  46.12 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1923  magnesium chelatase ChlI subunit  75.42 
 
 		 306 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  46.41 
 
 		 508 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  46.12 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  48.55 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  45.56 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  48.06 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  46.53 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  43.47 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  49.71 
 
 		 505 aa  412  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  46.44 
 
 		 520 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  50.1 
 
 		 506 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  48.94 
 
 		 508 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  43.99 
 
 		 516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  44.9 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  48.16 
 
 		 511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  45.91 
 
 		 507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  46.73 
 
 		 511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  42.35 
 
 		 512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  46.41 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  43.1 
 
 		 510 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  43.84 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  48.46 
 
 		 528 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  49.51 
 
 		 501 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  48.46 
 
 		 528 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  47.85 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  48.26 
 
 		 528 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  49.6 
 
 		 495 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  48.34 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  48.26 
 
 		 528 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  47.89 
 
 		 517 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  46.82 
 
 		 510 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  48.26 
 
 		 528 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  47.48 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  48.26 
 
 		 528 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  48.26 
 
 		 528 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>