More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0130 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0130  Mg chelatase-related protein  100 
 
 		 298 aa  590  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  94.97 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  87.25 
 
 		 512 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  86.91 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  85.57 
 
 		 512 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  86.58 
 
 		 512 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  86.58 
 
 		 512 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  72.3 
 
 		 512 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  73.29 
 
 		 512 aa  421  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1815  Mg chelatase, subunit ChlI  75.43 
 
 		 512 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  68.46 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  75.43 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  67.11 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1923  magnesium chelatase ChlI subunit  75.09 
 
 		 306 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  66.78 
 
 		 510 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  73.93 
 
 		 510 aa  407  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  73.63 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  74.48 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0363  hypothetical protein  66.11 
 
 		 510 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3547  Mg chelatase, subunit ChlI  67.79 
 
 		 532 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  67.45 
 
 		 510 aa  388  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2048  Mg chelatase-related protein  67.79 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0235921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3583  Mg chelatase, subunit ChlI  70.13 
 
 		 510 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1345  Mg chelatase-like protein  63.54 
 
 		 510 aa  379  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0565  Mg chelatase, subunit ChlI  68.18 
 
 		 512 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.509634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3594  Mg chelatase, subunit ChlI  66.09 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  66.32 
 
 		 502 aa  362  6e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  67.01 
 
 		 502 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0902  Mg chelatase-related protein  60.76 
 
 		 513 aa  346  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  63.23 
 
 		 502 aa  344  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  62.12 
 
 		 516 aa  335  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  62.5 
 
 		 500 aa  335  7e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  57.14 
 
 		 504 aa  328  8e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3017  Mg chelatase, subunit ChlI  61.95 
 
 		 509 aa  325  6e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  60.82 
 
 		 509 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  60.82 
 
 		 512 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  60.82 
 
 		 512 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  59.72 
 
 		 510 aa  312  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  65.28 
 
 		 506 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  50.34 
 
 		 502 aa  290  2e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  57.29 
 
 		 510 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  49.83 
 
 		 509 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  52.67 
 
 		 511 aa  280  1e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  51.54 
 
 		 513 aa  280  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  53.4 
 
 		 513 aa  280  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  51.53 
 
 		 511 aa  277  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  56.16 
 
 		 529 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  50.17 
 
 		 509 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  47.39 
 
 		 506 aa  276  4e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  49.14 
 
 		 512 aa  276  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  48.62 
 
 		 511 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  50.69 
 
 		 508 aa  275  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  48.47 
 
 		 509 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  51.2 
 
 		 554 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  52.2 
 
 		 506 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  53.61 
 
 		 512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  48.47 
 
 		 512 aa  271  1e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  47.06 
 
 		 501 aa  270  2e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  48.81 
 
 		 510 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  47.92 
 
 		 501 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  48.47 
 
 		 512 aa  269  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  46.67 
 
 		 509 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  50.17 
 
 		 513 aa  268  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  49.49 
 
 		 513 aa  268  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  47.57 
 
 		 501 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  46.58 
 
 		 510 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  45.3 
 
 		 500 aa  266  4e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  48.28 
 
 		 512 aa  266  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  45.76 
 
 		 510 aa  265  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  49.49 
 
 		 496 aa  265  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3674  magnesium chelatase ChlI subunit  48.07 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  47.08 
 
 		 512 aa  263  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  48.81 
 
 		 509 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  48.5 
 
 		 518 aa  263  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  48.8 
 
 		 513 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  47.96 
 
 		 512 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2773  competence protein ComM, putative  49.83 
 
 		 291 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  50.34 
 
 		 485 aa  262  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  49.49 
 
 		 505 aa  262  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  47.78 
 
 		 514 aa  261  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  47.47 
 
 		 516 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  46.78 
 
 		 508 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  51.03 
 
 		 506 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  50.34 
 
 		 520 aa  260  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  50.69 
 
 		 506 aa  259  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  52.05 
 
 		 504 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  48.47 
 
 		 511 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  50.34 
 
 		 517 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.68 
 
 		 528 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.68 
 
 		 528 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.68 
 
 		 528 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.68 
 
 		 528 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  50.17 
 
 		 507 aa  257  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  50.68 
 
 		 528 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  50.68 
 
 		 528 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0106  Mg(2+) chelatase family protein  48.98 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  50.87 
 
 		 505 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  47.08 
 
 		 512 aa  255  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  47.1 
 
 		 506 aa  255  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  51.72 
 
 		 503 aa  255  6e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>