More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2773 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2773  competence protein ComM, putative  100 
 
 		 291 aa  594  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  72.32 
 
 		 511 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  71.48 
 
 		 554 aa  427  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2728  magnesium chelatase ChlI subunit  68.42 
 
 		 324 aa  424  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  69.55 
 
 		 511 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  61.25 
 
 		 509 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  61.46 
 
 		 510 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  64.93 
 
 		 512 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  59.45 
 
 		 509 aa  364  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  60.76 
 
 		 513 aa  362  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  58.82 
 
 		 512 aa  360  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  57.79 
 
 		 509 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  56.7 
 
 		 512 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  58.13 
 
 		 508 aa  353  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  56.9 
 
 		 510 aa  350  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  56.01 
 
 		 513 aa  350  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  56.4 
 
 		 508 aa  348  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  55.71 
 
 		 509 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  56.69 
 
 		 506 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  54.48 
 
 		 512 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  55.33 
 
 		 513 aa  339  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  53.79 
 
 		 512 aa  337  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  55.86 
 
 		 514 aa  337  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  58.62 
 
 		 513 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  59.38 
 
 		 511 aa  335  3.9999999999999995e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3674  magnesium chelatase ChlI subunit  56.27 
 
 		 281 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  55.52 
 
 		 510 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  53.79 
 
 		 512 aa  333  1e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  54.48 
 
 		 511 aa  333  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  55.63 
 
 		 504 aa  329  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  53.1 
 
 		 512 aa  328  6e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  57.54 
 
 		 505 aa  325  5e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  54.36 
 
 		 509 aa  325  6e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  58.42 
 
 		 501 aa  325  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  52.43 
 
 		 509 aa  324  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  53.24 
 
 		 513 aa  324  9e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  54.33 
 
 		 512 aa  323  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  54.51 
 
 		 511 aa  322  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  54.64 
 
 		 509 aa  322  5e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  51.2 
 
 		 509 aa  319  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  52.92 
 
 		 509 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  53.17 
 
 		 506 aa  317  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  55.86 
 
 		 505 aa  315  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  53.1 
 
 		 516 aa  315  8e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  51.2 
 
 		 509 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  53.98 
 
 		 511 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  50.86 
 
 		 509 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  57.44 
 
 		 506 aa  311  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  52.11 
 
 		 507 aa  311  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  54.83 
 
 		 520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  47.57 
 
 		 506 aa  309  4e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  49.65 
 
 		 501 aa  308  5e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  51.55 
 
 		 509 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  54.51 
 
 		 512 aa  308  8e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  51.55 
 
 		 518 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  49.3 
 
 		 501 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  53.29 
 
 		 514 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  49.49 
 
 		 516 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  58.76 
 
 		 504 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  56.99 
 
 		 504 aa  305  7e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  51.2 
 
 		 518 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  51.06 
 
 		 506 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  51.89 
 
 		 518 aa  301  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  51.2 
 
 		 518 aa  300  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  53.52 
 
 		 499 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  47.55 
 
 		 507 aa  298  8e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  53.79 
 
 		 485 aa  297  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  53.17 
 
 		 513 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  54.17 
 
 		 506 aa  295  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  53.12 
 
 		 512 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  48.78 
 
 		 506 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  48.79 
 
 		 508 aa  292  4e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1377  Mg chelatase, subunit ChlI  46.74 
 
 		 519 aa  288  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000488427  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  54.86 
 
 		 512 aa  286  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0106  Mg(2+) chelatase family protein  52.25 
 
 		 284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  51.04 
 
 		 507 aa  285  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  52.82 
 
 		 523 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  46.13 
 
 		 504 aa  284  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  52.1 
 
 		 496 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 510 aa  282  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  47.95 
 
 		 514 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  52.63 
 
 		 505 aa  281  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  52.28 
 
 		 505 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5963  Mg chelatase, subunit ChlI  50.17 
 
 		 525 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  51.93 
 
 		 516 aa  280  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  52.13 
 
 		 530 aa  280  2e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  51.76 
 
 		 517 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1175  Mg chelatase, subunit ChlI  45.42 
 
 		 499 aa  278  8e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  52.3 
 
 		 516 aa  278  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  50.35 
 
 		 498 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  52.6 
 
 		 517 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  51.72 
 
 		 497 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  44.83 
 
 		 509 aa  275  5e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  52.46 
 
 		 496 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  50.35 
 
 		 510 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  52.82 
 
 		 496 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  51.54 
 
 		 501 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  52.82 
 
 		 496 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  51.56 
 
 		 516 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 		 515 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>