More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4252 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 516 aa  1052    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  59.21 
 
 		 509 aa  608  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  56.94 
 
 		 507 aa  581  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  57.82 
 
 		 508 aa  578  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  56.66 
 
 		 507 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  56.35 
 
 		 505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  55.91 
 
 		 509 aa  570  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  56.63 
 
 		 508 aa  565  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  56.66 
 
 		 507 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  56.26 
 
 		 507 aa  565  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  56.55 
 
 		 508 aa  561  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  55.42 
 
 		 509 aa  548  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  55.14 
 
 		 508 aa  545  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  54.83 
 
 		 508 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  55.47 
 
 		 507 aa  541  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4042  Mg chelatase, subunit ChlI  55.34 
 
 		 508 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3940  Mg chelatase, subunit ChlI  55.14 
 
 		 508 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  56.54 
 
 		 496 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4016  Mg chelatase, subunit ChlI  55.34 
 
 		 508 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  55.62 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  55.67 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  55.27 
 
 		 507 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4135  Mg chelatase, subunit ChlI  54.94 
 
 		 508 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  54.74 
 
 		 508 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  56.13 
 
 		 498 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  55.19 
 
 		 508 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  55.45 
 
 		 506 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  53.83 
 
 		 506 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  54.46 
 
 		 506 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  54.79 
 
 		 508 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  54.79 
 
 		 508 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  53.28 
 
 		 506 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  53.28 
 
 		 506 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  55.13 
 
 		 497 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  53.08 
 
 		 506 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  54.78 
 
 		 504 aa  532  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  52.88 
 
 		 506 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  53.08 
 
 		 506 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  55 
 
 		 498 aa  528  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  53.77 
 
 		 507 aa  529  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  53.48 
 
 		 506 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03644  predicted bifunctional enzyme and transcriptional regulator  52.94 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03593  hypothetical protein  52.94 
 
 		 516 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  53.57 
 
 		 507 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  53.37 
 
 		 506 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  56.14 
 
 		 497 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  55.53 
 
 		 497 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4133  putative ATP-dependent protease  52.98 
 
 		 506 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.815544  normal  0.463834 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  55.84 
 
 		 508 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4209  Mg chelatase, subunit ChlI  53.17 
 
 		 506 aa  524  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  55.69 
 
 		 485 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3983  putative ATP-dependent protease  53.37 
 
 		 506 aa  524  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3653  Mg chelatase, subunit ChlI  55.07 
 
 		 503 aa  525  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4236  putative ATP-dependent protease  53.37 
 
 		 506 aa  524  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250822  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 510 aa  521  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  53.83 
 
 		 510 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4153  putative ATP-dependent protease  52.98 
 
 		 506 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  54.13 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  54.27 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0392  Mg chelatase, subunit ChlI  55.31 
 
 		 504 aa  512  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  54.29 
 
 		 496 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  53.09 
 
 		 530 aa  504  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0197  Mg chelatase-related protein  54.6 
 
 		 497 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  52.06 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  56.25 
 
 		 495 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  52.27 
 
 		 510 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  51.7 
 
 		 506 aa  495  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  51.7 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  54.58 
 
 		 496 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  54.78 
 
 		 496 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  51.15 
 
 		 526 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.57 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.57 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  51.97 
 
 		 513 aa  488  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  50.57 
 
 		 528 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  47.95 
 
 		 511 aa  488  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  54.4 
 
 		 496 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  52.56 
 
 		 510 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  50.57 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.57 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  50.57 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.57 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0435  Mg chelatase, subunit ChlI  50.46 
 
 		 538 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  54.76 
 
 		 525 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  52.01 
 
 		 517 aa  482  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  52.18 
 
 		 501 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  51.07 
 
 		 517 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  51.35 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2785  Mg chelatase, subunit ChlI  50.38 
 
 		 528 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  51.71 
 
 		 523 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2254  Mg chelatase-related protein  50 
 
 		 534 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.049586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  52.3 
 
 		 504 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2879  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 		 534 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2923  Mg chelatase, subunit ChlI  49.62 
 
 		 536 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466076  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2868  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 		 534 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169459  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2393  Mg chelatase, subunit ChlI  51.86 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  50.87 
 
 		 516 aa  472  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  52.59 
 
 		 534 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  51.85 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  48 
 
 		 549 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>