More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1923 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1923  magnesium chelatase ChlI subunit  100 
 
 		 306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  99.01 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1815  Mg chelatase, subunit ChlI  96.7 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  86.53 
 
 		 512 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  85.48 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  83.44 
 
 		 512 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0130  Mg chelatase-related protein  75.09 
 
 		 298 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  71.81 
 
 		 512 aa  431  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  75.42 
 
 		 512 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  73.81 
 
 		 512 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  73.74 
 
 		 512 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  75.42 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  68.98 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  73.81 
 
 		 512 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  68.87 
 
 		 510 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  68.98 
 
 		 510 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  75.42 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0363  hypothetical protein  67.33 
 
 		 510 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2048  Mg chelatase-related protein  69.54 
 
 		 510 aa  397  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0235921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  69.21 
 
 		 510 aa  396  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3583  Mg chelatase, subunit ChlI  72.94 
 
 		 510 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3547  Mg chelatase, subunit ChlI  68.54 
 
 		 532 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0565  Mg chelatase, subunit ChlI  72.01 
 
 		 512 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.509634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1345  Mg chelatase-like protein  62.67 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  68.07 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  66.78 
 
 		 502 aa  364  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3594  Mg chelatase, subunit ChlI  64.97 
 
 		 516 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  66.11 
 
 		 502 aa  349  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  62.33 
 
 		 500 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  62.46 
 
 		 502 aa  332  7.000000000000001e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3017  Mg chelatase, subunit ChlI  64.57 
 
 		 509 aa  328  8e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  58.45 
 
 		 516 aa  326  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  57.19 
 
 		 504 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0902  Mg chelatase-related protein  54.88 
 
 		 513 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  59.73 
 
 		 512 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  59.73 
 
 		 512 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  60.07 
 
 		 510 aa  309  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  58.56 
 
 		 509 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  62.03 
 
 		 506 aa  289  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  57.82 
 
 		 510 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  46.44 
 
 		 506 aa  275  6e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  46.1 
 
 		 502 aa  274  1.0000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  48.98 
 
 		 511 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  52.54 
 
 		 511 aa  272  4.0000000000000004e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  45.21 
 
 		 500 aa  271  1e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  55.41 
 
 		 503 aa  271  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  46.6 
 
 		 501 aa  269  2.9999999999999997e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  53.4 
 
 		 513 aa  269  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  50.67 
 
 		 508 aa  267  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  54.27 
 
 		 529 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  53.06 
 
 		 512 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  48.31 
 
 		 496 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  45.92 
 
 		 509 aa  260  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  48.98 
 
 		 513 aa  258  6e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  48.14 
 
 		 512 aa  258  9e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  48.12 
 
 		 509 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  45.76 
 
 		 510 aa  257  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  46 
 
 		 509 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  47.8 
 
 		 513 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  46.1 
 
 		 512 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  46.44 
 
 		 512 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  51.52 
 
 		 506 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  49.66 
 
 		 520 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  46.82 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  46.44 
 
 		 512 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  52.22 
 
 		 495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  44.37 
 
 		 510 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  48.81 
 
 		 513 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  42.32 
 
 		 506 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  46.44 
 
 		 514 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  47.99 
 
 		 511 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  47.12 
 
 		 513 aa  252  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  48.68 
 
 		 506 aa  252  6e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  44.22 
 
 		 501 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  48.34 
 
 		 506 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  50.51 
 
 		 528 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.51 
 
 		 528 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.51 
 
 		 528 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  50.51 
 
 		 528 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  47.46 
 
 		 509 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  48.12 
 
 		 510 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  44.22 
 
 		 501 aa  250  2e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  50.17 
 
 		 517 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.51 
 
 		 528 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  50.51 
 
 		 528 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  50.51 
 
 		 504 aa  249  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  50.17 
 
 		 526 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  47.62 
 
 		 510 aa  249  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  50.83 
 
 		 497 aa  248  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  48.01 
 
 		 507 aa  248  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  50.68 
 
 		 496 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  50.17 
 
 		 528 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  49.15 
 
 		 554 aa  248  9e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  46.6 
 
 		 518 aa  247  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  48.64 
 
 		 518 aa  247  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  50.17 
 
 		 501 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  47.96 
 
 		 530 aa  247  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  45.27 
 
 		 512 aa  246  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  48.49 
 
 		 499 aa  246  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2728  magnesium chelatase ChlI subunit  48.15 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>