More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3961 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  64.93 
 
 		 500 aa  636    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 510 aa  992    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0902  Mg chelatase-related protein  66.4 
 
 		 513 aa  628  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  65.26 
 
 		 504 aa  620  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  68.34 
 
 		 509 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  68.45 
 
 		 512 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  68.45 
 
 		 512 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  58.15 
 
 		 512 aa  526  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  57.34 
 
 		 502 aa  525  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  53.89 
 
 		 510 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  57.95 
 
 		 502 aa  519  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  58.06 
 
 		 512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  58.06 
 
 		 512 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3594  Mg chelatase, subunit ChlI  56.44 
 
 		 516 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  55.78 
 
 		 516 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  57.06 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  55.29 
 
 		 510 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  56.26 
 
 		 512 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  54.69 
 
 		 512 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1345  Mg chelatase-like protein  51.5 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1815  Mg chelatase, subunit ChlI  57.57 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  57.97 
 
 		 512 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  57.66 
 
 		 512 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  55.65 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  57.46 
 
 		 512 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3017  Mg chelatase, subunit ChlI  58.32 
 
 		 509 aa  498  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  54.49 
 
 		 510 aa  495  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2048  Mg chelatase-related protein  54.49 
 
 		 510 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0235921  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  56.74 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  53.69 
 
 		 510 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3547  Mg chelatase, subunit ChlI  54.56 
 
 		 532 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0363  hypothetical protein  54.6 
 
 		 510 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  55.4 
 
 		 510 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  55.14 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3583  Mg chelatase, subunit ChlI  55.09 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  58.95 
 
 		 506 aa  478  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  55.44 
 
 		 512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0565  Mg chelatase, subunit ChlI  56.25 
 
 		 512 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.509634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  45.02 
 
 		 502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  45.36 
 
 		 506 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  54.15 
 
 		 503 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  51.1 
 
 		 499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  43.75 
 
 		 500 aa  440  9.999999999999999e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  48.24 
 
 		 520 aa  435  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  47.32 
 
 		 509 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  49.9 
 
 		 513 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  51.1 
 
 		 504 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  47.81 
 
 		 508 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  52.59 
 
 		 510 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  45.13 
 
 		 509 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  43.68 
 
 		 510 aa  425  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  48.19 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  47.02 
 
 		 509 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  42.89 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  43.14 
 
 		 511 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  47.11 
 
 		 498 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  46.03 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  49.7 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  45.63 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  43.34 
 
 		 508 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  48.96 
 
 		 485 aa  411  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  43.56 
 
 		 512 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  46.32 
 
 		 509 aa  411  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  45.24 
 
 		 509 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  43.56 
 
 		 501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  45.24 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  45.53 
 
 		 509 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  41.75 
 
 		 509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  48.31 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  44.02 
 
 		 516 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  44.87 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  48.31 
 
 		 506 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  44.86 
 
 		 513 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  44.47 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  43.45 
 
 		 512 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  43.81 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  45.78 
 
 		 507 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  41.15 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  43.54 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  45.92 
 
 		 509 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  46.39 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  44.89 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  49.7 
 
 		 498 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  48.05 
 
 		 512 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  50.9 
 
 		 501 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  49.11 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  45.89 
 
 		 508 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  47.09 
 
 		 508 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  45.15 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  46.06 
 
 		 496 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  42.39 
 
 		 512 aa  395  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  48.28 
 
 		 512 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  45.49 
 
 		 507 aa  395  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  46.63 
 
 		 508 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  47.4 
 
 		 507 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  48.44 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  42.34 
 
 		 512 aa  390  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  41.85 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  46.32 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  42.02 
 
 		 501 aa  392  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>