More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0179 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0161  Mg chelatase, subunit ChlI  99.61 
 
 
512 aa  997    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
512 aa  1001    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.511309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  74.51 
 
 
510 aa  734    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  77.54 
 
 
569 aa  735    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  72.11 
 
 
523 aa  719    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  72.8 
 
 
517 aa  719    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  69.03 
 
 
549 aa  698    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  79.81 
 
 
517 aa  769    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  72.03 
 
 
515 aa  713    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0170  putative Mg(2+) chelatase family protein  67.45 
 
 
534 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  66.6 
 
 
504 aa  615  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  60.31 
 
 
513 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  58.78 
 
 
510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  59.65 
 
 
498 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  59.33 
 
 
496 aa  552  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  59.27 
 
 
512 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  58.77 
 
 
510 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  60.47 
 
 
495 aa  541  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  57.41 
 
 
528 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  57.09 
 
 
526 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  57.41 
 
 
528 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  57.41 
 
 
528 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  57.41 
 
 
528 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  57.41 
 
 
528 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  57.41 
 
 
528 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  57.35 
 
 
528 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0435  Mg chelatase, subunit ChlI  56.99 
 
 
538 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2879  Mg chelatase, subunit ChlI  56.86 
 
 
534 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2254  Mg chelatase-related protein  56.86 
 
 
534 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.049586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2868  Mg chelatase, subunit ChlI  56.86 
 
 
534 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169459  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  53.73 
 
 
505 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2785  Mg chelatase, subunit ChlI  56.35 
 
 
528 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  59.65 
 
 
529 aa  502  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4192  Mg chelatase-related protein  56.77 
 
 
529 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2923  Mg chelatase, subunit ChlI  55.54 
 
 
536 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0523  Mg chelatase, subunit ChlI  56.09 
 
 
532 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887064  normal  0.860383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  54.69 
 
 
497 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  56.19 
 
 
497 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  55.8 
 
 
497 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  53.05 
 
 
510 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  53.98 
 
 
506 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  51.47 
 
 
507 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  53.82 
 
 
485 aa  472  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  50.86 
 
 
516 aa  474  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  53.22 
 
 
504 aa  472  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  52.63 
 
 
516 aa  472  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  55.91 
 
 
496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  55.91 
 
 
496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  49.32 
 
 
530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  50.1 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  54.1 
 
 
507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  52.06 
 
 
509 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  55.31 
 
 
501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  52.34 
 
 
507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  54.72 
 
 
496 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  50.68 
 
 
507 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  55.69 
 
 
498 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  51.76 
 
 
508 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  49.41 
 
 
509 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  53.33 
 
 
507 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  52.24 
 
 
508 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  51.36 
 
 
506 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  53.14 
 
 
507 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  55.31 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  51.97 
 
 
508 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  52.75 
 
 
507 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  49.61 
 
 
506 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  49.9 
 
 
506 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  49.71 
 
 
506 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  52.36 
 
 
508 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  49.61 
 
 
506 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03644  predicted bifunctional enzyme and transcriptional regulator  49.9 
 
 
516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4209  Mg chelatase, subunit ChlI  49.9 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  49.71 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  50.68 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4236  putative ATP-dependent protease  49.9 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250822  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03593  hypothetical protein  49.9 
 
 
516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  51.38 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  51.47 
 
 
508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  49.81 
 
 
506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  49.61 
 
 
506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3983  putative ATP-dependent protease  49.9 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  51.38 
 
 
506 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4133  putative ATP-dependent protease  49.71 
 
 
506 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.815544  normal  0.463834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  53.65 
 
 
499 aa  451  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  51.28 
 
 
501 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0640  hypothetical protein  48.54 
 
 
503 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0197  Mg chelatase-related protein  53.12 
 
 
497 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  49.71 
 
 
511 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  47.07 
 
 
508 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  51.95 
 
 
508 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  47.48 
 
 
509 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0624  hypothetical protein  48.54 
 
 
503 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  45.51 
 
 
516 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4153  putative ATP-dependent protease  49.31 
 
 
506 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  47.55 
 
 
508 aa  445  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  47.58 
 
 
509 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  49.8 
 
 
508 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  48.64 
 
 
509 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  47.06 
 
 
510 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>