100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB05360 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  58.16 
 
 
724 aa  818    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  56.91 
 
 
729 aa  824    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  100 
 
 
739 aa  1522    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  45.13 
 
 
709 aa  559  1e-158  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  45.85 
 
 
667 aa  557  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  38.88 
 
 
693 aa  403  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  35.57 
 
 
686 aa  378  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  37.7 
 
 
688 aa  369  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  34.08 
 
 
755 aa  352  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  40.66 
 
 
811 aa  350  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  33.67 
 
 
882 aa  348  2e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  33.47 
 
 
989 aa  345  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  33.83 
 
 
700 aa  344  4e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  35.37 
 
 
791 aa  342  1e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  39.17 
 
 
788 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  36.65 
 
 
717 aa  339  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  34.13 
 
 
686 aa  336  7.999999999999999e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  37.55 
 
 
695 aa  333  5e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  35.42 
 
 
841 aa  333  6e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  36.07 
 
 
679 aa  332  2e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  36.29 
 
 
680 aa  331  3e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  33.07 
 
 
689 aa  330  6e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  35.68 
 
 
680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  33 
 
 
700 aa  326  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  35.24 
 
 
682 aa  326  1e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  31.38 
 
 
706 aa  326  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  38.89 
 
 
847 aa  324  3e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  36.33 
 
 
796 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  35.16 
 
 
717 aa  320  7.999999999999999e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  41.63 
 
 
795 aa  317  5e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  33.48 
 
 
808 aa  317  5e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  31.11 
 
 
848 aa  314  4.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  35.33 
 
 
932 aa  313  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  34.47 
 
 
703 aa  310  5e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  33.49 
 
 
963 aa  310  6.999999999999999e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  35.34 
 
 
859 aa  308  3e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  33.66 
 
 
890 aa  308  3e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  35.41 
 
 
700 aa  308  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  36.46 
 
 
618 aa  306  9.000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  33.58 
 
 
694 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  39.74 
 
 
551 aa  305  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  37 
 
 
707 aa  303  5.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  32.59 
 
 
876 aa  303  8.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  32.06 
 
 
949 aa  302  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  46.69 
 
 
915 aa  300  9e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  45.99 
 
 
660 aa  292  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  31.26 
 
 
696 aa  291  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  36.19 
 
 
556 aa  281  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  29.01 
 
 
761 aa  232  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  29.02 
 
 
675 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  34.29 
 
 
1059 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 
1342 aa  215  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  40.07 
 
 
873 aa  213  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  41.18 
 
 
458 aa  211  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  28.01 
 
 
717 aa  211  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  28.9 
 
 
674 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  31.25 
 
 
674 aa  207  8e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  31.43 
 
 
467 aa  205  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  31.47 
 
 
674 aa  206  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  34.43 
 
 
1064 aa  204  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  28.86 
 
 
668 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  27.07 
 
 
670 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  28.73 
 
 
676 aa  197  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  29.6 
 
 
674 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  29.96 
 
 
672 aa  195  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  27.68 
 
 
717 aa  188  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  28.88 
 
 
676 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  26.23 
 
 
710 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  28.52 
 
 
676 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  28.88 
 
 
672 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  34.63 
 
 
487 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  28.76 
 
 
676 aa  178  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  27 
 
 
710 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  27 
 
 
710 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  26.29 
 
 
710 aa  174  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  25.85 
 
 
710 aa  160  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  26.32 
 
 
724 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  34.3 
 
 
1412 aa  146  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  30.24 
 
 
626 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  28.47 
 
 
607 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  28.17 
 
 
677 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  28.17 
 
 
677 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  26.5 
 
 
507 aa  47.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  25 
 
 
501 aa  47.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1784  putative Mg chelatase-like protein  21.71 
 
 
501 aa  47.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  25 
 
 
501 aa  47.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  27 
 
 
506 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  22.15 
 
 
507 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  23.6 
 
 
507 aa  45.8  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  24.16 
 
 
508 aa  45.8  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  28.26 
 
 
506 aa  45.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  19.94 
 
 
512 aa  45.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  30.22 
 
 
508 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0221  Mg chelatase-related protein  21.38 
 
 
501 aa  45.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  30.89 
 
 
620 aa  45.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  25.85 
 
 
509 aa  44.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0200  Mg chelatase-related protein  21.38 
 
 
501 aa  44.7  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  22.65 
 
 
509 aa  44.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  24.83 
 
 
507 aa  44.3  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0183  Mg chelatase-related protein  21.05 
 
 
501 aa  44.3  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>