126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0919 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  53.73 
 
 		 674 aa  764    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  96.43 
 
 		 676 aa  1313    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  83.63 
 
 		 672 aa  1168    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  64.99 
 
 		 676 aa  902    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  60.39 
 
 		 676 aa  834    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  94.94 
 
 		 676 aa  1298    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  60.53 
 
 		 668 aa  837    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  60.57 
 
 		 670 aa  863    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  53.13 
 
 		 674 aa  755    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  56.12 
 
 		 674 aa  808    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  54.78 
 
 		 674 aa  781    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  100 
 
 		 672 aa  1350    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  43.82 
 
 		 710 aa  529  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  45.98 
 
 		 710 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  46.47 
 
 		 710 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  45.53 
 
 		 717 aa  521  1e-146  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  45.81 
 
 		 710 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  45 
 
 		 677 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  45 
 
 		 677 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  39.61 
 
 		 626 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  39.39 
 
 		 724 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  40.57 
 
 		 607 aa  340  7e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  32.06 
 
 		 700 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  34.05 
 
 		 689 aa  311  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  32.56 
 
 		 706 aa  310  5e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  31.52 
 
 		 700 aa  306  7e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  32.89 
 
 		 717 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  32.21 
 
 		 694 aa  296  8e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  30.13 
 
 		 696 aa  293  7e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  33.39 
 
 		 700 aa  289  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  30.58 
 
 		 693 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  34.52 
 
 		 686 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  31.16 
 
 		 703 aa  282  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  30.98 
 
 		 688 aa  281  2e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  32.69 
 
 		 679 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  34.35 
 
 		 680 aa  271  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  31.84 
 
 		 682 aa  269  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  31.99 
 
 		 680 aa  266  8e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  29.6 
 
 		 695 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  32.4 
 
 		 686 aa  240  5.999999999999999e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  30.08 
 
 		 882 aa  235  2.0000000000000002e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  30.52 
 
 		 989 aa  229  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  28.72 
 
 		 811 aa  219  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  27.73 
 
 		 755 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  36.14 
 
 		 873 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  27.08 
 
 		 791 aa  206  8e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  34.16 
 
 		 551 aa  205  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  26.55 
 
 		 675 aa  203  9e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  29.38 
 
 		 788 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  28.8 
 
 		 717 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  28.35 
 
 		 808 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  27.86 
 
 		 710 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  25.37 
 
 		 761 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  28.27 
 
 		 932 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  27.99 
 
 		 618 aa  197  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  27.91 
 
 		 795 aa  195  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  30.43 
 
 		 729 aa  195  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  24.5 
 
 		 717 aa  194  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  27.71 
 
 		 949 aa  193  9e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  28.15 
 
 		 848 aa  192  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  26.3 
 
 		 709 aa  191  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  24.96 
 
 		 667 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  31.22 
 
 		 847 aa  187  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  32.99 
 
 		 458 aa  185  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  28.88 
 
 		 739 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  26.91 
 
 		 796 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  28.42 
 
 		 556 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  26.86 
 
 		 890 aa  180  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  34.42 
 
 		 1412 aa  178  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  27 
 
 		 876 aa  177  8e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  32.58 
 
 		 963 aa  177  8e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  31.62 
 
 		 1059 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  32.67 
 
 		 1342 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  26.76 
 
 		 707 aa  174  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  28.63 
 
 		 724 aa  174  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  30.52 
 
 		 841 aa  172  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  26.25 
 
 		 859 aa  166  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  31.92 
 
 		 915 aa  165  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  34.03 
 
 		 1064 aa  160  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1640  MCM family DNA replication protein  35.46 
 
 		 246 aa  151  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  30.46 
 
 		 660 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  23.89 
 
 		 487 aa  127  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  24.17 
 
 		 467 aa  107  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  26.32 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  21.73 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  22.18 
 
 		 513 aa  48.5  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  20.86 
 
 		 523 aa  48.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  23.02 
 
 		 504 aa  48.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  25.62 
 
 		 498 aa  47.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  24.88 
 
 		 506 aa  48.1  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  25.36 
 
 		 512 aa  47.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  23.17 
 
 		 314 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  22.37 
 
 		 701 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  19.15 
 
 		 362 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  21.11 
 
 		 500 aa  47  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  24.34 
 
 		 526 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2254  Mg chelatase-related protein  23.81 
 
 		 534 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.049586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2868  Mg chelatase, subunit ChlI  23.81 
 
 		 534 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  21.58 
 
 		 515 aa  46.2  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  26.51 
 
 		 506 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>