More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4481 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  100 
 
 
314 aa  652    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  45.83 
 
 
340 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  44.22 
 
 
614 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.37 
 
 
335 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  46.79 
 
 
333 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.81 
 
 
369 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  46.43 
 
 
337 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.81 
 
 
373 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  46.43 
 
 
337 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.17 
 
 
374 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.13 
 
 
362 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  43.09 
 
 
309 aa  255  7e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.49 
 
 
362 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.26 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.85 
 
 
358 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.85 
 
 
358 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  40.89 
 
 
362 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.85 
 
 
357 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.37 
 
 
616 aa  249  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1645  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.25 
 
 
357 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000343633  normal  0.0310882 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  40.89 
 
 
362 aa  248  8e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.49 
 
 
364 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.23 
 
 
674 aa  247  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.17 
 
 
362 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.17 
 
 
362 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.21 
 
 
405 aa  246  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.53 
 
 
674 aa  246  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  40.58 
 
 
362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  43 
 
 
594 aa  244  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.81 
 
 
788 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  41.85 
 
 
362 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  48.41 
 
 
618 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5002  Magnesium chelatase  45.25 
 
 
358 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.0000241174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  41.9 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  47.2 
 
 
629 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  43.65 
 
 
776 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  41.21 
 
 
362 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.99 
 
 
337 aa  242  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.39 
 
 
622 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.39 
 
 
622 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.39 
 
 
622 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1178  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.92 
 
 
358 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1658  magnesium chelatase  48.92 
 
 
358 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  41.57 
 
 
669 aa  241  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.82 
 
 
386 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.67 
 
 
337 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.67 
 
 
337 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  43.77 
 
 
650 aa  240  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.32 
 
 
383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  43.22 
 
 
637 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.77 
 
 
391 aa  239  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3151  magnesium chelatase  44.44 
 
 
342 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  43.71 
 
 
342 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  44.84 
 
 
337 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  45.1 
 
 
626 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.54 
 
 
394 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  40.63 
 
 
346 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  40.2 
 
 
334 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.51 
 
 
384 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.19 
 
 
383 aa  236  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.63 
 
 
382 aa  235  7e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  39.88 
 
 
688 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.04 
 
 
653 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  40.31 
 
 
347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  43.92 
 
 
638 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.59 
 
 
340 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.17 
 
 
363 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  40.62 
 
 
345 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  37.92 
 
 
680 aa  231  9e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  39.87 
 
 
364 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  43.77 
 
 
344 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  38.67 
 
 
336 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  43.01 
 
 
653 aa  229  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  40.71 
 
 
337 aa  228  8e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2221  putative magnesium chelatase  44.52 
 
 
336 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.83 
 
 
673 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1632  magnesium chelatase  48.92 
 
 
358 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0600916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.35 
 
 
340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  40.32 
 
 
372 aa  225  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  39.58 
 
 
341 aa  225  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.74 
 
 
348 aa  225  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  45.28 
 
 
699 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4807  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.08 
 
 
358 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1577  magnesium chelatase  44.66 
 
 
360 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  0.343579 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  39.62 
 
 
397 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  42.21 
 
 
334 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.82 
 
 
386 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.82 
 
 
351 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  37.58 
 
 
443 aa  223  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.67 
 
 
340 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  39.43 
 
 
365 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  40.13 
 
 
637 aa  223  4e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  39.5 
 
 
351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  43.17 
 
 
705 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  42.27 
 
 
660 aa  222  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  41.88 
 
 
334 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.35 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2350  magnesium chelatase, ChlI subunit  47.69 
 
 
566 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.252625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  37.97 
 
 
364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  39.74 
 
 
637 aa  220  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>