More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1621 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  86.98 
 
 
384 aa  654    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  100 
 
 
382 aa  770    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  84.65 
 
 
391 aa  634    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  87.05 
 
 
386 aa  630  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  88.15 
 
 
386 aa  624  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  78.33 
 
 
383 aa  605  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  77.55 
 
 
383 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  61.4 
 
 
369 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  61.11 
 
 
374 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  65.5 
 
 
370 aa  414  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.77 
 
 
357 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.06 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.06 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.06 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.65 
 
 
362 aa  404  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  57.6 
 
 
362 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  56.6 
 
 
405 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  56.46 
 
 
364 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  56.85 
 
 
362 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  56.16 
 
 
362 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  56.97 
 
 
362 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  56.85 
 
 
362 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  57.23 
 
 
362 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  56.93 
 
 
362 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  55.91 
 
 
362 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.68 
 
 
377 aa  388  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.72 
 
 
379 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.23 
 
 
337 aa  378  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.23 
 
 
337 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.27 
 
 
337 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  57.48 
 
 
363 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  58.53 
 
 
334 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.31 
 
 
340 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  58.24 
 
 
334 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  55.16 
 
 
397 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  56.01 
 
 
334 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.73 
 
 
340 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  56.21 
 
 
394 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.14 
 
 
336 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  57.35 
 
 
334 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.14 
 
 
340 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.02 
 
 
340 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  51.6 
 
 
443 aa  355  5e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.05 
 
 
341 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.07 
 
 
348 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.79 
 
 
341 aa  348  9e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.26 
 
 
368 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.49 
 
 
688 aa  343  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  52.84 
 
 
669 aa  339  5e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  51.85 
 
 
364 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  52.78 
 
 
680 aa  331  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  49.13 
 
 
364 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  56.89 
 
 
339 aa  325  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  48.84 
 
 
346 aa  325  8.000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  51.66 
 
 
347 aa  324  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  47.7 
 
 
346 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  49.71 
 
 
372 aa  323  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  48.92 
 
 
356 aa  323  3e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.08 
 
 
337 aa  320  3e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  50.92 
 
 
345 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  50.6 
 
 
351 aa  318  9e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  51.03 
 
 
365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.99 
 
 
616 aa  308  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  48.01 
 
 
637 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  48.01 
 
 
637 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  49.54 
 
 
337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  50.31 
 
 
696 aa  294  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  49.38 
 
 
637 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.3 
 
 
674 aa  285  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  45.94 
 
 
614 aa  280  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  47.68 
 
 
660 aa  279  6e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  49.84 
 
 
705 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.32 
 
 
665 aa  276  5e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  45.89 
 
 
650 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.86 
 
 
788 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  46.25 
 
 
653 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  46.86 
 
 
356 aa  272  6e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  49.54 
 
 
674 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  46.42 
 
 
689 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  48.06 
 
 
738 aa  269  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  44.28 
 
 
749 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  48.16 
 
 
699 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  50.15 
 
 
713 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  42.28 
 
 
309 aa  263  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  48.6 
 
 
670 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  47.75 
 
 
680 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  44.51 
 
 
340 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  47.75 
 
 
730 aa  259  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  44.27 
 
 
594 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.55 
 
 
622 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.55 
 
 
622 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  44.58 
 
 
776 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.55 
 
 
622 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.48 
 
 
335 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  44.3 
 
 
337 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  47.75 
 
 
719 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  44.3 
 
 
337 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  44.51 
 
 
626 aa  255  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  47.04 
 
 
618 aa  252  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.07 
 
 
351 aa  252  9.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>