283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1902 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  100 
 
 
379 aa  758    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  94.69 
 
 
377 aa  688    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  69.92 
 
 
370 aa  488  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  61.76 
 
 
337 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  61.76 
 
 
337 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.56 
 
 
391 aa  414  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.56 
 
 
384 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  61.25 
 
 
337 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.89 
 
 
383 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  60.8 
 
 
386 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.17 
 
 
382 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.76 
 
 
383 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.57 
 
 
340 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.54 
 
 
336 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  58.76 
 
 
394 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.14 
 
 
340 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.86 
 
 
340 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  58 
 
 
340 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  58.91 
 
 
348 aa  388  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  61.58 
 
 
386 aa  388  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.26 
 
 
341 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.93 
 
 
369 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.37 
 
 
405 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  57.14 
 
 
374 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  61.13 
 
 
368 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.71 
 
 
373 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.25 
 
 
341 aa  378  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.83 
 
 
357 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  56.1 
 
 
334 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.15 
 
 
362 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.78 
 
 
362 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  58.91 
 
 
334 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.32 
 
 
358 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  58.91 
 
 
334 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.32 
 
 
358 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  58.91 
 
 
334 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.49 
 
 
362 aa  363  2e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.07 
 
 
362 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.58 
 
 
362 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.57 
 
 
362 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  56.16 
 
 
362 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.42 
 
 
364 aa  361  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.57 
 
 
362 aa  358  6e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.72 
 
 
362 aa  358  9e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  54.44 
 
 
372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  52.79 
 
 
346 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.93 
 
 
688 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  51.59 
 
 
669 aa  346  4e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  56.64 
 
 
363 aa  345  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.43 
 
 
616 aa  344  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  50 
 
 
680 aa  342  5e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  51.68 
 
 
365 aa  341  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.85 
 
 
337 aa  338  8e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  47.75 
 
 
356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  51.28 
 
 
337 aa  335  7e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  57.59 
 
 
339 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  50.7 
 
 
397 aa  333  3e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  50.86 
 
 
364 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  49.57 
 
 
346 aa  332  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  49.85 
 
 
364 aa  328  8e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.58 
 
 
788 aa  328  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  49.55 
 
 
637 aa  327  3e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  49.55 
 
 
637 aa  325  7e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  54.57 
 
 
776 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  51.31 
 
 
696 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  50 
 
 
351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  48.01 
 
 
443 aa  318  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  50.3 
 
 
347 aa  316  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  51.98 
 
 
660 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  47.21 
 
 
345 aa  308  9e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  51.18 
 
 
637 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  48.7 
 
 
749 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  53.8 
 
 
670 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.11 
 
 
665 aa  303  5.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  53.04 
 
 
738 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  54.2 
 
 
674 aa  296  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  53.2 
 
 
713 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.84 
 
 
674 aa  292  6e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  50 
 
 
689 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  51.93 
 
 
680 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  46.39 
 
 
614 aa  288  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  53.62 
 
 
730 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.49 
 
 
673 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  52.14 
 
 
719 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  43.12 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  49.58 
 
 
705 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  52.86 
 
 
657 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  43.03 
 
 
309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  49.7 
 
 
719 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  53.43 
 
 
690 aa  269  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  49.01 
 
 
699 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.87 
 
 
335 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  47.25 
 
 
754 aa  261  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  47.38 
 
 
618 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  47.87 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.6 
 
 
351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  46.04 
 
 
344 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.07 
 
 
622 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.07 
 
 
622 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  43.73 
 
 
638 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>