More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3462 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  55.51 
 
 
749 aa  693    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  100 
 
 
754 aa  1439    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  67.22 
 
 
719 aa  443  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  39.32 
 
 
705 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.9 
 
 
688 aa  299  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  38.77 
 
 
699 aa  293  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  50 
 
 
364 aa  290  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  48.32 
 
 
345 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.16 
 
 
616 aa  287  5e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  48.77 
 
 
346 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  47.32 
 
 
669 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  47.24 
 
 
372 aa  282  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  39.95 
 
 
680 aa  278  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  47.32 
 
 
364 aa  277  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.25 
 
 
337 aa  276  8e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  47.84 
 
 
351 aa  274  5.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  47.06 
 
 
347 aa  274  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  46.54 
 
 
637 aa  273  6e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  46.54 
 
 
637 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  42.41 
 
 
356 aa  272  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.08 
 
 
369 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  41.83 
 
 
696 aa  270  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.17 
 
 
405 aa  267  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  48.77 
 
 
365 aa  266  8e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.98 
 
 
362 aa  266  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.91 
 
 
362 aa  266  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.88 
 
 
665 aa  266  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.88 
 
 
362 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.19 
 
 
362 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.86 
 
 
364 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.33 
 
 
374 aa  265  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  47.98 
 
 
337 aa  264  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.57 
 
 
362 aa  262  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  43.79 
 
 
362 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  44.44 
 
 
346 aa  260  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.76 
 
 
379 aa  260  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.37 
 
 
337 aa  259  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.46 
 
 
377 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.78 
 
 
337 aa  259  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.37 
 
 
337 aa  259  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.57 
 
 
370 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.38 
 
 
373 aa  259  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.51 
 
 
362 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.51 
 
 
362 aa  258  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.73 
 
 
362 aa  257  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.97 
 
 
357 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.75 
 
 
368 aa  250  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  47.69 
 
 
637 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.48 
 
 
386 aa  249  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.51 
 
 
358 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.51 
 
 
358 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48.29 
 
 
363 aa  244  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.36 
 
 
348 aa  243  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.37 
 
 
336 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.26 
 
 
383 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  45.19 
 
 
689 aa  241  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.33 
 
 
674 aa  240  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.55 
 
 
384 aa  240  9e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.73 
 
 
341 aa  239  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.62 
 
 
340 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.65 
 
 
391 aa  238  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.51 
 
 
340 aa  237  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.57 
 
 
383 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  42.49 
 
 
443 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.46 
 
 
673 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  46.67 
 
 
776 aa  235  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.17 
 
 
386 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.65 
 
 
340 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  43.53 
 
 
334 aa  234  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.17 
 
 
340 aa  234  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  41.95 
 
 
397 aa  233  7.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  45.4 
 
 
660 aa  233  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.44 
 
 
382 aa  232  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.42 
 
 
394 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.39 
 
 
341 aa  229  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  45.69 
 
 
670 aa  228  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  45.85 
 
 
638 aa  227  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  37.53 
 
 
614 aa  226  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  49.12 
 
 
730 aa  226  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  47.94 
 
 
680 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  38.41 
 
 
356 aa  225  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  47.28 
 
 
626 aa  224  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  48.55 
 
 
657 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  43.29 
 
 
334 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  42.99 
 
 
334 aa  221  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  43.34 
 
 
334 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.74 
 
 
622 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.74 
 
 
622 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.74 
 
 
622 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  44.05 
 
 
653 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.79 
 
 
351 aa  216  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  48.6 
 
 
674 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  43.95 
 
 
340 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  42.57 
 
 
333 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.49 
 
 
600 aa  212  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  44.05 
 
 
650 aa  211  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.81 
 
 
335 aa  211  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  48.91 
 
 
713 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  44.44 
 
 
337 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  44.44 
 
 
337 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>