More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2088 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  100 
 
 
600 aa  1209    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  39.42 
 
 
680 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.48 
 
 
665 aa  364  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  36.62 
 
 
696 aa  349  7e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  49.73 
 
 
372 aa  349  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  55.41 
 
 
637 aa  347  3e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  55.1 
 
 
637 aa  345  1e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  54.86 
 
 
346 aa  343  5e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  53.33 
 
 
364 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  54.11 
 
 
660 aa  327  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.25 
 
 
688 aa  326  9e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  51.27 
 
 
669 aa  323  5e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  50 
 
 
356 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  38.57 
 
 
637 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  50.32 
 
 
356 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  49.37 
 
 
365 aa  313  7.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  52.23 
 
 
364 aa  312  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  35.66 
 
 
614 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.84 
 
 
373 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.95 
 
 
616 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.25 
 
 
369 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.89 
 
 
374 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  50 
 
 
670 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.94 
 
 
364 aa  294  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.62 
 
 
405 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.74 
 
 
357 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.94 
 
 
358 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.94 
 
 
358 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  48.9 
 
 
345 aa  290  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  47.17 
 
 
346 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  47.2 
 
 
351 aa  288  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  47.02 
 
 
347 aa  286  8e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  47 
 
 
337 aa  286  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  47 
 
 
337 aa  286  8e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  33.76 
 
 
705 aa  286  9e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.53 
 
 
340 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.55 
 
 
340 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  47 
 
 
337 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  47.92 
 
 
689 aa  283  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.17 
 
 
340 aa  283  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.76 
 
 
368 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.11 
 
 
337 aa  282  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.71 
 
 
341 aa  282  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  35.19 
 
 
674 aa  281  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.79 
 
 
340 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.79 
 
 
362 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.86 
 
 
362 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  33.59 
 
 
653 aa  279  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  47.3 
 
 
334 aa  279  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.86 
 
 
362 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  47.13 
 
 
337 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.86 
 
 
362 aa  276  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.65 
 
 
362 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.65 
 
 
362 aa  274  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.65 
 
 
362 aa  273  7e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.63 
 
 
348 aa  272  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.03 
 
 
362 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.74 
 
 
336 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.03 
 
 
362 aa  267  4e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.32 
 
 
370 aa  267  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.39 
 
 
671 aa  267  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  45.68 
 
 
749 aa  267  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  45.4 
 
 
443 aa  265  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.7 
 
 
341 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.06 
 
 
394 aa  264  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.97 
 
 
363 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  47.13 
 
 
334 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  45.71 
 
 
776 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.14 
 
 
383 aa  256  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.91 
 
 
377 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.07 
 
 
622 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.07 
 
 
622 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.07 
 
 
622 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  46.52 
 
 
334 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.44 
 
 
788 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  46.2 
 
 
334 aa  252  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.55 
 
 
379 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.79 
 
 
386 aa  249  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.93 
 
 
383 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  42.27 
 
 
397 aa  248  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  34.35 
 
 
638 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.89 
 
 
384 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.79 
 
 
382 aa  241  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.44 
 
 
391 aa  240  5e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  46.96 
 
 
713 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  45.71 
 
 
738 aa  237  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  28.62 
 
 
594 aa  236  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.78 
 
 
673 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.24 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.31 
 
 
674 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  42.81 
 
 
650 aa  234  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  49.2 
 
 
657 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  44.76 
 
 
719 aa  233  8.000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  45.4 
 
 
730 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  47.32 
 
 
690 aa  231  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  44.98 
 
 
719 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.35 
 
 
351 aa  228  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  45.11 
 
 
339 aa  228  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  44.97 
 
 
680 aa  226  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  40.26 
 
 
337 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>