More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1693 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  100 
 
 		 340 aa  678    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  94.41 
 
 		 340 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  94.12 
 
 		 340 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  89.71 
 
 		 340 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  76.01 
 
 		 348 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  73.81 
 
 		 336 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  72.62 
 
 		 337 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  72.32 
 
 		 337 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  71.64 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  71.18 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  66.57 
 
 		 341 aa  451  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  68.64 
 
 		 341 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  69.69 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  63.08 
 
 		 334 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  63.13 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  63.13 
 
 		 334 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  62.83 
 
 		 334 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.55 
 
 		 383 aa  394  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.77 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.57 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  58.89 
 
 		 386 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.57 
 
 		 379 aa  388  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.1 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.77 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  65.68 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.31 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.31 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.14 
 
 		 688 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.41 
 
 		 362 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.41 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.43 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.41 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.8 
 
 		 373 aa  364  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.22 
 
 		 374 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.12 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.96 
 
 		 405 aa  362  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.41 
 
 		 362 aa  362  5.0000000000000005e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.69 
 
 		 364 aa  360  1e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.21 
 
 		 357 aa  358  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.82 
 
 		 362 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.78 
 
 		 369 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.52 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.66 
 
 		 358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.66 
 
 		 358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.52 
 
 		 362 aa  355  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.23 
 
 		 362 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.12 
 
 		 363 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  53.45 
 
 		 346 aa  347  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  54.01 
 
 		 372 aa  343  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  51.72 
 
 		 669 aa  340  1e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.66 
 
 		 616 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.99 
 
 		 337 aa  332  6e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  53.07 
 
 		 365 aa  332  8e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  50.44 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  50.91 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  48.3 
 
 		 356 aa  328  6e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  49.7 
 
 		 337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  48.82 
 
 		 346 aa  325  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  49.53 
 
 		 637 aa  324  1e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  49.53 
 
 		 637 aa  324  1e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.76 
 
 		 680 aa  323  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  49.41 
 
 		 397 aa  323  4e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  52.68 
 
 		 689 aa  320  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  53.68 
 
 		 637 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  52.35 
 
 		 696 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.91 
 
 		 665 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  46.43 
 
 		 443 aa  316  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  51.89 
 
 		 660 aa  312  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  49.69 
 
 		 351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  54.55 
 
 		 670 aa  306  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.93 
 
 		 788 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  48.07 
 
 		 345 aa  305  6e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  48.92 
 
 		 347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  52.27 
 
 		 776 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  56.04 
 
 		 674 aa  293  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  46.18 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.69 
 
 		 674 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  54.35 
 
 		 713 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  52.94 
 
 		 705 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  46.97 
 
 		 749 aa  288  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.16 
 
 		 600 aa  285  9e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  50.89 
 
 		 680 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  47.45 
 
 		 614 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  52.69 
 
 		 738 aa  279  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  53.59 
 
 		 730 aa  278  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  54.6 
 
 		 657 aa  275  8e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  55.59 
 
 		 690 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.39 
 
 		 673 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  43.61 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  50.58 
 
 		 719 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  49.06 
 
 		 719 aa  262  8e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  50.15 
 
 		 699 aa  262  8e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  48.45 
 
 		 629 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.53 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  49.08 
 
 		 618 aa  259  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.27 
 
 		 622 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.27 
 
 		 622 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.27 
 
 		 622 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  45.82 
 
 		 626 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  46.39 
 
 		 653 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>