More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3502 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  100 
 
 		 334 aa  664    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  76.88 
 
 		 334 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  76.58 
 
 		 334 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  76.58 
 
 		 334 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  76.67 
 
 		 339 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  69.67 
 
 		 337 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  69.28 
 
 		 337 aa  448  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  68.98 
 
 		 337 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  68.15 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  66.67 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  63.82 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  65.19 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  64.71 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  63.08 
 
 		 340 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  63.08 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  63.56 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  62.65 
 
 		 341 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  65.11 
 
 		 368 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.01 
 
 		 382 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.06 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.43 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.09 
 
 		 391 aa  360  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.71 
 
 		 383 aa  361  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.78 
 
 		 386 aa  360  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.81 
 
 		 384 aa  358  7e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.98 
 
 		 377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.1 
 
 		 379 aa  356  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.59 
 
 		 362 aa  348  8e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.13 
 
 		 386 aa  348  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  50.3 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.86 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  50.3 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  50 
 
 		 362 aa  345  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.04 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.65 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.45 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.93 
 
 		 358 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.93 
 
 		 358 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  50.91 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  51.81 
 
 		 362 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  51.81 
 
 		 362 aa  339  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.01 
 
 		 374 aa  339  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.89 
 
 		 405 aa  334  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.04 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.59 
 
 		 373 aa  333  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.98 
 
 		 616 aa  328  6e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  51.76 
 
 		 363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  51.49 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  50.76 
 
 		 346 aa  323  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.47 
 
 		 688 aa  322  6e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  52.34 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  48.8 
 
 		 337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  51.39 
 
 		 346 aa  318  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.76 
 
 		 680 aa  316  3e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  51.39 
 
 		 372 aa  315  5e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  50.47 
 
 		 669 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  48.07 
 
 		 397 aa  312  5.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  49.7 
 
 		 351 aa  309  4e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  48.77 
 
 		 364 aa  309  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  51.55 
 
 		 637 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  45.48 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  48.79 
 
 		 347 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.72 
 
 		 674 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  48.75 
 
 		 637 aa  301  1e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  48.75 
 
 		 637 aa  300  2e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.99 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  52.02 
 
 		 696 aa  299  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.94 
 
 		 665 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  47.02 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  44.35 
 
 		 443 aa  294  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.9 
 
 		 788 aa  294  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  52.98 
 
 		 670 aa  288  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  52.44 
 
 		 680 aa  285  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  54.23 
 
 		 674 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  48.6 
 
 		 660 aa  282  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  52.04 
 
 		 705 aa  282  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  46.33 
 
 		 356 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  50.15 
 
 		 776 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  55.17 
 
 		 690 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  49.04 
 
 		 689 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  46.08 
 
 		 614 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.46 
 
 		 622 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.46 
 
 		 622 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.46 
 
 		 622 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  50.47 
 
 		 629 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  51.23 
 
 		 699 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  53.61 
 
 		 713 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.86 
 
 		 600 aa  267  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  52.04 
 
 		 738 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  54.37 
 
 		 657 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  47.92 
 
 		 638 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  48.42 
 
 		 626 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  50.45 
 
 		 719 aa  264  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  49.38 
 
 		 618 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  52.04 
 
 		 730 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  48.09 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  48.09 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.47 
 
 		 673 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.11 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  46.15 
 
 		 653 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>