More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13860 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  100 
 
 
351 aa  710    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50 
 
 
688 aa  306  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  48.37 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  49.39 
 
 
365 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  48.34 
 
 
346 aa  300  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  46.36 
 
 
364 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.16 
 
 
616 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  46.81 
 
 
337 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  48.28 
 
 
637 aa  290  3e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  48.16 
 
 
364 aa  288  9e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  50 
 
 
309 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  47.65 
 
 
637 aa  287  2e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  45.22 
 
 
351 aa  287  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  45.87 
 
 
345 aa  286  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  47.11 
 
 
347 aa  285  9e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  50.67 
 
 
618 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50 
 
 
622 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50 
 
 
622 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50 
 
 
622 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  45.21 
 
 
669 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  43.84 
 
 
362 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.68 
 
 
674 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  52.51 
 
 
629 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  48.94 
 
 
614 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  43.55 
 
 
362 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  49.34 
 
 
626 aa  278  8e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  46.89 
 
 
346 aa  278  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.34 
 
 
674 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.44 
 
 
362 aa  276  4e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.65 
 
 
362 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  47.98 
 
 
638 aa  275  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45 
 
 
337 aa  275  9e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.14 
 
 
362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  46.11 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  41.4 
 
 
680 aa  273  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  43.49 
 
 
637 aa  272  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.44 
 
 
337 aa  272  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.22 
 
 
337 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  47.26 
 
 
696 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.22 
 
 
337 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  49.64 
 
 
337 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  49.11 
 
 
340 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  41.89 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  50.9 
 
 
650 aa  269  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  49.28 
 
 
337 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.34 
 
 
788 aa  268  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.6 
 
 
665 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.94 
 
 
362 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  41.42 
 
 
362 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.34 
 
 
362 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.39 
 
 
368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.07 
 
 
382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.53 
 
 
394 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.84 
 
 
383 aa  265  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.53 
 
 
340 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.54 
 
 
383 aa  263  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.57 
 
 
341 aa  263  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.2 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  48.76 
 
 
333 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  41.64 
 
 
356 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.58 
 
 
335 aa  262  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.91 
 
 
340 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.85 
 
 
336 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.84 
 
 
384 aa  259  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.84 
 
 
391 aa  258  8e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.6 
 
 
340 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.31 
 
 
364 aa  258  9e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  48.96 
 
 
653 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.6 
 
 
379 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.54 
 
 
386 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.6 
 
 
377 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  44.78 
 
 
776 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.94 
 
 
363 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.6 
 
 
340 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.59 
 
 
357 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.51 
 
 
341 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.24 
 
 
374 aa  256  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.87 
 
 
369 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  48.16 
 
 
713 aa  255  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  43.79 
 
 
680 aa  255  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.77 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.54 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.54 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.07 
 
 
405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.39 
 
 
344 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.33 
 
 
653 aa  252  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  47.72 
 
 
674 aa  252  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.92 
 
 
348 aa  251  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  45.32 
 
 
738 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  46.15 
 
 
689 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  42.06 
 
 
443 aa  249  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  48.94 
 
 
337 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.54 
 
 
386 aa  248  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  48.23 
 
 
342 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  43.07 
 
 
334 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  43.07 
 
 
334 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.31 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  43.47 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  39.94 
 
 
356 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  45.51 
 
 
719 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>