More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4585 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  100 
 
 		 335 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  71.94 
 
 		 340 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  72.51 
 
 		 337 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  70.76 
 
 		 337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  72.12 
 
 		 333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  73.19 
 
 		 342 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  71.93 
 
 		 344 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  72.56 
 
 		 333 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  74.18 
 
 		 337 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2221  putative magnesium chelatase  76.19 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  52.06 
 
 		 594 aa  322  5e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3151  magnesium chelatase  55.12 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1645  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.88 
 
 		 357 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000343633  normal  0.0310882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1178  magnesium chelatase, ChlI subunit  54.05 
 
 		 358 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1658  magnesium chelatase  54.05 
 
 		 358 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5002  Magnesium chelatase  58.08 
 
 		 358 aa  289  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.0000241174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  53.55 
 
 		 626 aa  285  8e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.82 
 
 		 674 aa  285  9e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5745  magnesium chelatase  54.13 
 
 		 386 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1577  magnesium chelatase  53.59 
 
 		 360 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  0.343579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4807  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.12 
 
 		 358 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.77 
 
 		 622 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.77 
 
 		 622 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.77 
 
 		 622 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.69 
 
 		 616 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1632  magnesium chelatase  54.05 
 
 		 358 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1558  magnesium chelatase  52.07 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.58 
 
 		 788 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.83 
 
 		 674 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  51.72 
 
 		 638 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1956  magnesium chelatase, subunit ChII  54.46 
 
 		 445 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1940  magnesium chelatase, subunit ChII  54.46 
 
 		 427 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0275  putative magnesium-chelatase subunit  54.46 
 
 		 427 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150915  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0885  magnesium chelatase, subunit ChII  54.46 
 
 		 427 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1613  magnesium chelatase, subunit ChII  54.46 
 
 		 427 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109459  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  57.04 
 
 		 629 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.84 
 
 		 374 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2406  magnesium-chelatase subunit D/I family protein  55.02 
 
 		 416 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736001  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  44.48 
 
 		 614 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2101  magnesium chelatase, subunit ChII  54.89 
 
 		 427 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  55.09 
 
 		 618 aa  266  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.52 
 
 		 357 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  47.95 
 
 		 364 aa  262  6.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  44.1 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  45.74 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.2 
 
 		 373 aa  259  7e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.2 
 
 		 405 aa  258  7e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.84 
 
 		 369 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  50.18 
 
 		 650 aa  258  8e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1581  magnesium chelatase  53.49 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.28 
 
 		 688 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.48 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.2 
 
 		 364 aa  255  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  44.9 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  45.11 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  45.2 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  42.21 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.53 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  43.08 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.47 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.87 
 
 		 379 aa  253  3e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.87 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.89 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.89 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  44.79 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.85 
 
 		 386 aa  252  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.2 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.38 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  47.69 
 
 		 637 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.22 
 
 		 384 aa  250  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  46.62 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  45.71 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  50.31 
 
 		 776 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.58 
 
 		 351 aa  249  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.52 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.85 
 
 		 383 aa  249  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.09 
 
 		 653 aa  248  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.54 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  47.99 
 
 		 680 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  38.93 
 
 		 680 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2350  magnesium chelatase, ChlI subunit  57.3 
 
 		 566 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.252625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.47 
 
 		 340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  44.08 
 
 		 653 aa  245  6.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.23 
 
 		 362 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  42.9 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.92 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  42.6 
 
 		 669 aa  243  3e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.31 
 
 		 362 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.47 
 
 		 337 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.94 
 
 		 362 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.94 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.83 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.2 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.51 
 
 		 370 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  48.62 
 
 		 699 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.15 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.83 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.76 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.77 
 
 		 363 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.84 
 
 		 340 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>