More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2350 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2350  magnesium chelatase, ChlI subunit  100 
 
 		 566 aa  1064    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.252625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  46.52 
 
 		 614 aa  459  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  50.57 
 
 		 637 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  37.61 
 
 		 688 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  47.24 
 
 		 618 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  39.22 
 
 		 650 aa  356  7.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  40.56 
 
 		 660 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  36.14 
 
 		 680 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  44.28 
 
 		 629 aa  339  7e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  38.59 
 
 		 669 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  44.01 
 
 		 626 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.01 
 
 		 622 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.01 
 
 		 622 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.01 
 
 		 622 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  38.35 
 
 		 653 aa  331  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.84 
 
 		 673 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  43.99 
 
 		 638 aa  317  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  44.9 
 
 		 674 aa  309  9e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  40.75 
 
 		 705 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.75 
 
 		 665 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  45.82 
 
 		 657 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  52.23 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  39.54 
 
 		 670 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  56.15 
 
 		 335 aa  290  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  50.64 
 
 		 372 aa  289  8e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  59.79 
 
 		 337 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  54.17 
 
 		 342 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  54.36 
 
 		 333 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.09 
 
 		 616 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  55.52 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.67 
 
 		 333 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.48 
 
 		 337 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.48 
 
 		 337 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  51.43 
 
 		 364 aa  279  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  46.88 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.48 
 
 		 337 aa  279  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2221  putative magnesium chelatase  61.21 
 
 		 336 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  48.25 
 
 		 364 aa  278  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  46.26 
 
 		 309 aa  277  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.52 
 
 		 788 aa  276  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  54.45 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  51.13 
 
 		 334 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  54.8 
 
 		 337 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  54.8 
 
 		 337 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.27 
 
 		 340 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.27 
 
 		 340 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  47.17 
 
 		 351 aa  270  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.71 
 
 		 394 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.5 
 
 		 368 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  33.66 
 
 		 594 aa  267  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.34 
 
 		 340 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  45.05 
 
 		 346 aa  266  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  45.98 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.91 
 
 		 341 aa  265  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.38 
 
 		 671 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  49.58 
 
 		 776 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.39 
 
 		 362 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.94 
 
 		 674 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  46.37 
 
 		 347 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.62 
 
 		 369 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.71 
 
 		 340 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.62 
 
 		 370 aa  263  6.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.77 
 
 		 374 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.77 
 
 		 405 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.02 
 
 		 362 aa  262  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.45 
 
 		 373 aa  262  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.54 
 
 		 348 aa  260  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.08 
 
 		 362 aa  261  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.14 
 
 		 362 aa  261  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  50.96 
 
 		 689 aa  260  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.08 
 
 		 362 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.71 
 
 		 362 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.83 
 
 		 383 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  47.02 
 
 		 314 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.45 
 
 		 362 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.45 
 
 		 357 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.45 
 
 		 362 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.08 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.05 
 
 		 336 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.08 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  50.8 
 
 		 334 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.25 
 
 		 377 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.83 
 
 		 383 aa  257  4e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.71 
 
 		 351 aa  257  4e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  47.6 
 
 		 365 aa  257  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  50.8 
 
 		 334 aa  257  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.77 
 
 		 668 aa  256  9e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.83 
 
 		 382 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.14 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.63 
 
 		 341 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  50.8 
 
 		 334 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.83 
 
 		 364 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.65 
 
 		 379 aa  253  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  49.36 
 
 		 696 aa  253  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.14 
 
 		 386 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.45 
 
 		 337 aa  250  4e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  27.73 
 
 		 643 aa  249  7e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.89 
 
 		 384 aa  249  9e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  41.23 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  33.28 
 
 		 690 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>