More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2134 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 		 674 aa  1294    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.19 
 
 		 622 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.19 
 
 		 622 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.19 
 
 		 622 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  53.38 
 
 		 629 aa  547  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  53.58 
 
 		 626 aa  535  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  52.99 
 
 		 638 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  53.51 
 
 		 618 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  49.93 
 
 		 705 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.09 
 
 		 674 aa  495  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  49.29 
 
 		 699 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.7 
 
 		 673 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  51.46 
 
 		 680 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.55 
 
 		 653 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  47.91 
 
 		 713 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  49.56 
 
 		 657 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  47.67 
 
 		 719 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.47 
 
 		 688 aa  429  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  48.05 
 
 		 674 aa  425  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  44 
 
 		 637 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  38.26 
 
 		 680 aa  411  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  41.16 
 
 		 653 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  40.96 
 
 		 696 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  38.44 
 
 		 650 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  39.18 
 
 		 614 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  37.59 
 
 		 669 aa  368  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  39.22 
 
 		 670 aa  336  7.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.42 
 
 		 665 aa  332  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.76 
 
 		 616 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.76 
 
 		 788 aa  321  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  50.59 
 
 		 364 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  52.4 
 
 		 364 aa  313  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  52.02 
 
 		 346 aa  301  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  50 
 
 		 345 aa  300  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  55.15 
 
 		 738 aa  297  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  55.94 
 
 		 337 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  55.02 
 
 		 340 aa  297  5e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  32.72 
 
 		 594 aa  296  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  55.94 
 
 		 337 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.83 
 
 		 335 aa  292  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  48.8 
 
 		 351 aa  291  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  54.67 
 
 		 333 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  52.66 
 
 		 776 aa  289  9e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.68 
 
 		 351 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  49.13 
 
 		 347 aa  287  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  48.2 
 
 		 372 aa  286  8e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  46.62 
 
 		 309 aa  286  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  46.32 
 
 		 356 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.88 
 
 		 337 aa  283  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  47.19 
 
 		 337 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.56 
 
 		 337 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  50 
 
 		 365 aa  280  5e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.63 
 
 		 333 aa  280  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.44 
 
 		 337 aa  280  8e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  51.56 
 
 		 337 aa  279  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.81 
 
 		 364 aa  278  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.34 
 
 		 336 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.34 
 
 		 369 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  46.89 
 
 		 346 aa  277  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  53.9 
 
 		 342 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.04 
 
 		 383 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  50 
 
 		 334 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  49.68 
 
 		 334 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.73 
 
 		 382 aa  272  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.55 
 
 		 386 aa  273  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.9 
 
 		 362 aa  273  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  49.68 
 
 		 334 aa  272  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.11 
 
 		 362 aa  272  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  49.06 
 
 		 334 aa  272  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.11 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.96 
 
 		 405 aa  271  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.55 
 
 		 391 aa  271  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.73 
 
 		 384 aa  270  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.42 
 
 		 383 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.9 
 
 		 374 aa  270  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.11 
 
 		 362 aa  269  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.04 
 
 		 362 aa  269  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.26 
 
 		 357 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.31 
 
 		 340 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.11 
 
 		 362 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  53.85 
 
 		 344 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.48 
 
 		 362 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  54.25 
 
 		 730 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.48 
 
 		 362 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.95 
 
 		 358 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.95 
 
 		 358 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  50.53 
 
 		 314 aa  267  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  53.42 
 
 		 337 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  45 
 
 		 373 aa  266  7e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.73 
 
 		 362 aa  265  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  57.68 
 
 		 690 aa  264  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  44.48 
 
 		 397 aa  264  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.84 
 
 		 341 aa  263  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.61 
 
 		 341 aa  262  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.66 
 
 		 363 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2221  putative magnesium chelatase  53.92 
 
 		 336 aa  260  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  44.72 
 
 		 443 aa  260  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.04 
 
 		 386 aa  259  8e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.63 
 
 		 348 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1645  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.53 
 
 		 357 aa  259  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000343633  normal  0.0310882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>