288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1046 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  85.64 
 
 
383 aa  671    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  100 
 
 
383 aa  775    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  81.25 
 
 
384 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  82.25 
 
 
386 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  83.24 
 
 
391 aa  593  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  77.55 
 
 
382 aa  590  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  80.05 
 
 
386 aa  579  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  59.04 
 
 
374 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.36 
 
 
369 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  64.43 
 
 
370 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  59.65 
 
 
364 aa  411  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.55 
 
 
357 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.38 
 
 
358 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.76 
 
 
373 aa  411  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.73 
 
 
405 aa  408  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.38 
 
 
358 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  56.23 
 
 
362 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  56.23 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  55.94 
 
 
362 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.94 
 
 
362 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  56.23 
 
 
362 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.36 
 
 
362 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.94 
 
 
377 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.18 
 
 
362 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.98 
 
 
362 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.89 
 
 
379 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.86 
 
 
337 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.52 
 
 
337 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.55 
 
 
340 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.52 
 
 
337 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.8 
 
 
362 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  56.34 
 
 
397 aa  379  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.1 
 
 
340 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.65 
 
 
340 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  57.27 
 
 
334 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  55.43 
 
 
334 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.23 
 
 
340 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  57.57 
 
 
334 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.47 
 
 
363 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  56.97 
 
 
334 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.93 
 
 
368 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.27 
 
 
336 aa  362  9e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.43 
 
 
394 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.71 
 
 
341 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.2 
 
 
348 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  49.85 
 
 
443 aa  352  5e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.41 
 
 
341 aa  351  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.13 
 
 
688 aa  346  5e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  51.91 
 
 
364 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  53.27 
 
 
669 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  48.83 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  52.38 
 
 
680 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  51.51 
 
 
345 aa  336  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  50.62 
 
 
364 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  51.48 
 
 
372 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  51.02 
 
 
351 aa  330  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  56.93 
 
 
339 aa  326  4.0000000000000003e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.69 
 
 
337 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  50.6 
 
 
347 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  49.4 
 
 
346 aa  323  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  50 
 
 
356 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.31 
 
 
616 aa  319  5e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  50.29 
 
 
365 aa  316  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  46.48 
 
 
637 aa  306  3e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  46.48 
 
 
637 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  48.29 
 
 
337 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  50 
 
 
696 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  45.62 
 
 
614 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  47.35 
 
 
637 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.45 
 
 
674 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  48.1 
 
 
660 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.34 
 
 
665 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  44.57 
 
 
749 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  45.57 
 
 
650 aa  280  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  45.71 
 
 
356 aa  279  6e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.49 
 
 
788 aa  276  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  48.42 
 
 
705 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  49.53 
 
 
670 aa  272  7e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  46.73 
 
 
680 aa  270  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  45.92 
 
 
738 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  48.24 
 
 
713 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  42.17 
 
 
309 aa  265  7e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  44.06 
 
 
653 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  44.59 
 
 
594 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  49.38 
 
 
674 aa  263  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  44.17 
 
 
626 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  43.3 
 
 
689 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  43.67 
 
 
337 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  43.67 
 
 
337 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  42.95 
 
 
340 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  47.79 
 
 
657 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.17 
 
 
622 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.17 
 
 
622 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.17 
 
 
622 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  43.85 
 
 
337 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  46.75 
 
 
699 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  43.08 
 
 
333 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  43.7 
 
 
638 aa  256  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  44.69 
 
 
344 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  44.62 
 
 
776 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>