More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0485 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  100 
 
 		 394 aa  779    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  72.06 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  72.35 
 
 		 337 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  71.89 
 
 		 337 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  71.18 
 
 		 340 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  72.06 
 
 		 340 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  71.6 
 
 		 336 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  69.71 
 
 		 340 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  69.71 
 
 		 340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  70.35 
 
 		 348 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  68.36 
 
 		 334 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  69.73 
 
 		 341 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  73.12 
 
 		 368 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  64.76 
 
 		 341 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  65.98 
 
 		 334 aa  411  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  66.86 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  66.86 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  67.06 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.76 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.82 
 
 		 377 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.26 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.05 
 
 		 382 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.82 
 
 		 370 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.87 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.57 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.68 
 
 		 384 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.94 
 
 		 386 aa  362  6e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.46 
 
 		 386 aa  358  6e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.85 
 
 		 362 aa  358  8e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.55 
 
 		 358 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.55 
 
 		 358 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.46 
 
 		 405 aa  355  8.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.98 
 
 		 362 aa  354  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.65 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.94 
 
 		 362 aa  354  1e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.24 
 
 		 362 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.51 
 
 		 373 aa  353  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.21 
 
 		 374 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.45 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.45 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.68 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.31 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.09 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.55 
 
 		 362 aa  345  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  50.59 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  52.12 
 
 		 346 aa  342  8e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.25 
 
 		 688 aa  341  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  56.36 
 
 		 363 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.46 
 
 		 616 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  51.17 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  50.92 
 
 		 346 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  52.31 
 
 		 372 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  49.23 
 
 		 680 aa  326  5e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  50.31 
 
 		 669 aa  325  9e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  51.86 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  49.38 
 
 		 637 aa  318  9e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  49.38 
 
 		 637 aa  318  1e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  45 
 
 		 356 aa  315  8e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  50.44 
 
 		 397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  49.08 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  48.81 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  51.55 
 
 		 637 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  52.98 
 
 		 776 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  51.4 
 
 		 696 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.85 
 
 		 788 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  50.31 
 
 		 347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.48 
 
 		 337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.67 
 
 		 665 aa  302  7.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  45.13 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  46.88 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  49.53 
 
 		 660 aa  298  8e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  48.16 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  52.2 
 
 		 689 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  54.46 
 
 		 705 aa  296  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  53.92 
 
 		 680 aa  292  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.62 
 
 		 674 aa  292  6e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  52.05 
 
 		 670 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  43.99 
 
 		 356 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  54.49 
 
 		 674 aa  282  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  46.43 
 
 		 749 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  46.96 
 
 		 614 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  53.27 
 
 		 738 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  54.55 
 
 		 730 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  53.67 
 
 		 719 aa  277  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  56.27 
 
 		 657 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  53.42 
 
 		 713 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  53.82 
 
 		 699 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.32 
 
 		 673 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.53 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  49.23 
 
 		 629 aa  264  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.06 
 
 		 600 aa  261  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  50.93 
 
 		 618 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  54.15 
 
 		 690 aa  258  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  46.37 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  46.82 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  46.69 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  47.2 
 
 		 653 aa  258  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  46.5 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  41.12 
 
 		 309 aa  255  8e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  49.22 
 
 		 719 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>