More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1952 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  95.58 
 
 
362 aa  695    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  100 
 
 
362 aa  721    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  89.5 
 
 
363 aa  634    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  83.66 
 
 
362 aa  614  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  83.38 
 
 
362 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  83.57 
 
 
362 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  81.22 
 
 
362 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  81.34 
 
 
362 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  81.22 
 
 
362 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  81.49 
 
 
362 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  75.35 
 
 
364 aa  548  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  74.57 
 
 
405 aa  536  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  73.26 
 
 
374 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  74.12 
 
 
369 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  73.18 
 
 
358 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  73.18 
 
 
358 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  73.76 
 
 
357 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  71.02 
 
 
373 aa  520  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  64.6 
 
 
397 aa  444  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  61.36 
 
 
443 aa  443  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.3 
 
 
383 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.6 
 
 
382 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.94 
 
 
383 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.52 
 
 
391 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.85 
 
 
384 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  56.65 
 
 
386 aa  393  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  57.43 
 
 
386 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  53.33 
 
 
346 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  54.24 
 
 
372 aa  361  9e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.5 
 
 
370 aa  358  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  57.63 
 
 
616 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.17 
 
 
336 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.01 
 
 
337 aa  352  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  54.01 
 
 
669 aa  351  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  50.15 
 
 
346 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.57 
 
 
337 aa  349  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.01 
 
 
340 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.49 
 
 
379 aa  349  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.57 
 
 
337 aa  349  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.05 
 
 
377 aa  348  6e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  52.59 
 
 
334 aa  348  9e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.12 
 
 
340 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  54.18 
 
 
365 aa  344  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.3 
 
 
688 aa  342  5e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  50 
 
 
351 aa  341  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  51.83 
 
 
364 aa  339  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  50.3 
 
 
637 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  50.3 
 
 
637 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.82 
 
 
340 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  49.11 
 
 
345 aa  333  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.68 
 
 
394 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  51.22 
 
 
364 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.66 
 
 
341 aa  332  4e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  53.39 
 
 
334 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  51.05 
 
 
347 aa  332  6e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  52.23 
 
 
340 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  53.1 
 
 
334 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.45 
 
 
337 aa  329  4e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  47.35 
 
 
356 aa  329  6e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  53.27 
 
 
334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.61 
 
 
368 aa  326  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  53.05 
 
 
341 aa  322  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  48.95 
 
 
680 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.71 
 
 
348 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.71 
 
 
674 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  53.27 
 
 
660 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  53.58 
 
 
637 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  55.92 
 
 
339 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  52.35 
 
 
670 aa  310  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  47.84 
 
 
337 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  49.57 
 
 
696 aa  300  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.37 
 
 
665 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.12 
 
 
788 aa  295  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  49.69 
 
 
776 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  48.64 
 
 
749 aa  294  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  52.02 
 
 
713 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  53.44 
 
 
674 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  53.12 
 
 
657 aa  285  7e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  52.92 
 
 
738 aa  285  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  49.24 
 
 
699 aa  285  9e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  50 
 
 
705 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  47.68 
 
 
653 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  53.44 
 
 
730 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  45.03 
 
 
356 aa  280  3e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  46.44 
 
 
614 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  47.15 
 
 
689 aa  279  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  42.99 
 
 
309 aa  278  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1645  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50 
 
 
357 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000343633  normal  0.0310882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.69 
 
 
673 aa  275  8e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  50.46 
 
 
680 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  49.38 
 
 
618 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  53.58 
 
 
690 aa  269  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  47.22 
 
 
340 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  46.84 
 
 
650 aa  266  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  47.94 
 
 
337 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5002  Magnesium chelatase  48.64 
 
 
358 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.0000241174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.59 
 
 
622 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  51.05 
 
 
719 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.59 
 
 
622 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.59 
 
 
622 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>