More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0751 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  100 
 
 
309 aa  614  1e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  47.69 
 
 
346 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  47.24 
 
 
372 aa  315  8e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.45 
 
 
688 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  45 
 
 
364 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  44.44 
 
 
351 aa  291  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  45.29 
 
 
680 aa  288  7e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  46.13 
 
 
346 aa  288  7e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.04 
 
 
337 aa  286  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  47.8 
 
 
356 aa  286  4e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  43.84 
 
 
345 aa  285  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  43.56 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  43.07 
 
 
347 aa  281  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  40.71 
 
 
364 aa  278  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.99 
 
 
362 aa  278  9e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  48.26 
 
 
618 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.51 
 
 
362 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.51 
 
 
362 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  48.75 
 
 
650 aa  275  6e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  44.27 
 
 
669 aa  275  6e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.07 
 
 
362 aa  273  3e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.02 
 
 
788 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  46.71 
 
 
614 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.25 
 
 
622 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.51 
 
 
362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.25 
 
 
622 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.55 
 
 
369 aa  272  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.25 
 
 
622 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.55 
 
 
362 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.81 
 
 
362 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.87 
 
 
383 aa  272  5.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50 
 
 
351 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  42.09 
 
 
337 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.51 
 
 
362 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0275  magnesium chelatase, ChlI subunit  58.01 
 
 
275 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.36 
 
 
616 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  41.9 
 
 
362 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.71 
 
 
386 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.21 
 
 
374 aa  268  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  47.06 
 
 
653 aa  268  8e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  46.58 
 
 
626 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.41 
 
 
364 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.38 
 
 
357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.02 
 
 
405 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.17 
 
 
383 aa  265  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.62 
 
 
674 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.52 
 
 
373 aa  265  7e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.9 
 
 
384 aa  265  7e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.2 
 
 
358 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.2 
 
 
358 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.28 
 
 
382 aa  263  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  41.45 
 
 
776 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  45.75 
 
 
638 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.72 
 
 
337 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  43.07 
 
 
696 aa  259  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.9 
 
 
377 aa  258  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.51 
 
 
391 aa  258  9e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  43.12 
 
 
660 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.03 
 
 
379 aa  256  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  42.19 
 
 
637 aa  256  3e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  44.1 
 
 
443 aa  255  6e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.09 
 
 
337 aa  255  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  42.19 
 
 
637 aa  255  6e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  40.96 
 
 
336 aa  255  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.52 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.09 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  45.36 
 
 
314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  42.21 
 
 
335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  43.39 
 
 
333 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.56 
 
 
341 aa  252  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  43.25 
 
 
340 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  44.06 
 
 
337 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  41.77 
 
 
637 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  42.99 
 
 
363 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  46.18 
 
 
629 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.34 
 
 
370 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.25 
 
 
340 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.82 
 
 
665 aa  249  3e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.61 
 
 
340 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  41.61 
 
 
356 aa  249  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  43.71 
 
 
337 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  41.07 
 
 
368 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  43.31 
 
 
334 aa  246  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  43.08 
 
 
334 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  43.08 
 
 
334 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.32 
 
 
674 aa  245  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  42.77 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.61 
 
 
340 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  41.46 
 
 
680 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.61 
 
 
340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2350  magnesium chelatase, ChlI subunit  46.26 
 
 
566 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.252625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.12 
 
 
394 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.11 
 
 
653 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  41.38 
 
 
670 aa  239  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5002  Magnesium chelatase  43.45 
 
 
358 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.0000241174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.64 
 
 
348 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  40.58 
 
 
689 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.14 
 
 
333 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  42.25 
 
 
594 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1645  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.21 
 
 
357 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000343633  normal  0.0310882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>