More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2423 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  100 
 
 		 340 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  93.82 
 
 		 337 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  93.24 
 
 		 337 aa  597  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  88.53 
 
 		 333 aa  587  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  73.55 
 
 		 344 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  75.22 
 
 		 333 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  73.05 
 
 		 335 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  72.01 
 
 		 342 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  68.53 
 
 		 337 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2221  putative magnesium chelatase  69.41 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  51.72 
 
 		 594 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3151  magnesium chelatase  55.09 
 
 		 342 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1178  magnesium chelatase, ChlI subunit  54.35 
 
 		 358 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1658  magnesium chelatase  54.35 
 
 		 358 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1645  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.55 
 
 		 357 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000343633  normal  0.0310882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5002  Magnesium chelatase  61.37 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.0000241174 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1558  magnesium chelatase  54.63 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.31 
 
 		 674 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4807  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  56.53 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1577  magnesium chelatase  54.35 
 
 		 360 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  0.343579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1632  magnesium chelatase  54.05 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.68 
 
 		 616 aa  285  9e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  46.79 
 
 		 346 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.82 
 
 		 622 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.82 
 
 		 622 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.82 
 
 		 622 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  56.84 
 
 		 629 aa  281  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  53.92 
 
 		 626 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5745  magnesium chelatase  52.3 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  55.02 
 
 		 674 aa  277  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1581  magnesium chelatase  53.56 
 
 		 360 aa  275  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  46.54 
 
 		 372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.68 
 
 		 788 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2101  magnesium chelatase, subunit ChII  55.84 
 
 		 427 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1940  magnesium chelatase, subunit ChII  55.84 
 
 		 427 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1956  magnesium chelatase, subunit ChII  55.84 
 
 		 445 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0885  magnesium chelatase, subunit ChII  55.84 
 
 		 427 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0275  putative magnesium-chelatase subunit  55.84 
 
 		 427 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150915  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1613  magnesium chelatase, subunit ChII  55.84 
 
 		 427 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109459  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  46.35 
 
 		 614 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  53.14 
 
 		 638 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  44.07 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  54.9 
 
 		 618 aa  269  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.53 
 
 		 362 aa  268  7e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.62 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.22 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2406  magnesium-chelatase subunit D/I family protein  54.92 
 
 		 416 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736001  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.6 
 
 		 364 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.94 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.68 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.94 
 
 		 358 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.94 
 
 		 358 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.26 
 
 		 688 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.94 
 
 		 373 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.37 
 
 		 362 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.51 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  44.07 
 
 		 345 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  47.37 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.51 
 
 		 653 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  44.21 
 
 		 653 aa  262  6e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.37 
 
 		 362 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  46.79 
 
 		 314 aa  261  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.2 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.65 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.34 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  45.03 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  48.04 
 
 		 650 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.2 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.28 
 
 		 405 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.75 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.75 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.2 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  44.75 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  45.74 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.51 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  47.32 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  45.43 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  42.95 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.11 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  43.5 
 
 		 669 aa  256  5e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.4 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  42.99 
 
 		 347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.91 
 
 		 363 aa  252  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  43.25 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.93 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  47.32 
 
 		 696 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.37 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2350  magnesium chelatase, ChlI subunit  54.45 
 
 		 566 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.252625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  47.53 
 
 		 776 aa  248  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.69 
 
 		 665 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.69 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  50.78 
 
 		 673 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.37 
 
 		 337 aa  247  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.37 
 
 		 394 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.37 
 
 		 337 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.51 
 
 		 386 aa  245  8e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  43.12 
 
 		 637 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  47.95 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  47.95 
 
 		 334 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  48.77 
 
 		 680 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>