84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11490 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  100 
 
 		 667 aa  1361    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  47.82 
 
 		 729 aa  580  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  48.66 
 
 		 724 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  45.42 
 
 		 739 aa  555  1e-157  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  47.06 
 
 		 709 aa  558  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  37.02 
 
 		 688 aa  403  1e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  38.47 
 
 		 693 aa  404  1e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  35.67 
 
 		 686 aa  364  3e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  40.55 
 
 		 680 aa  360  5e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  37.44 
 
 		 680 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  40.03 
 
 		 682 aa  354  2e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  37.39 
 
 		 679 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  37.12 
 
 		 700 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  35.6 
 
 		 755 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  34.85 
 
 		 706 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  35.87 
 
 		 695 aa  343  5e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  34.96 
 
 		 689 aa  335  1e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  36.64 
 
 		 686 aa  332  2e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  33.95 
 
 		 707 aa  330  6e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  34.29 
 
 		 694 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  36.07 
 
 		 882 aa  327  3e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  35.26 
 
 		 848 aa  327  6e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  35.21 
 
 		 847 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  32.21 
 
 		 703 aa  319  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  37.88 
 
 		 811 aa  319  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  35.2 
 
 		 700 aa  316  7e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  39.03 
 
 		 788 aa  316  9e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  35.59 
 
 		 717 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  38.9 
 
 		 791 aa  314  3.9999999999999997e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  33.53 
 
 		 989 aa  313  5.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  33.8 
 
 		 700 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  34.59 
 
 		 841 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  40.69 
 
 		 551 aa  310  5e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  33.39 
 
 		 796 aa  310  5e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  34.78 
 
 		 932 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  35.36 
 
 		 876 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  32.62 
 
 		 963 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  37.8 
 
 		 795 aa  303  8.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  36.77 
 
 		 717 aa  302  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  32.38 
 
 		 890 aa  296  6e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  35.16 
 
 		 949 aa  296  7e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  37.23 
 
 		 618 aa  295  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  34.87 
 
 		 808 aa  290  5.0000000000000004e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  31.81 
 
 		 696 aa  290  6e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  37.01 
 
 		 915 aa  280  7e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  44.7 
 
 		 660 aa  273  7e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  30.35 
 
 		 859 aa  271  2.9999999999999997e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  35.7 
 
 		 556 aa  253  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  31.62 
 
 		 675 aa  230  7e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  27.95 
 
 		 674 aa  220  6e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  27.8 
 
 		 674 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  27.3 
 
 		 674 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  30.37 
 
 		 761 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  30.08 
 
 		 668 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  36.26 
 
 		 1059 aa  211  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  41.31 
 
 		 873 aa  210  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  40.75 
 
 		 458 aa  209  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  27.13 
 
 		 670 aa  207  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  37.27 
 
 		 1342 aa  204  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  29.29 
 
 		 676 aa  204  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  29.3 
 
 		 674 aa  203  9e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  38.11 
 
 		 1064 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  28.99 
 
 		 717 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  25.72 
 
 		 676 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  32.88 
 
 		 467 aa  198  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  25.83 
 
 		 676 aa  195  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  25.18 
 
 		 676 aa  193  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  25.97 
 
 		 672 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  24.96 
 
 		 672 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  31 
 
 		 487 aa  188  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  27.72 
 
 		 710 aa  181  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  29.13 
 
 		 717 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  25.99 
 
 		 710 aa  172  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  28 
 
 		 710 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  27.41 
 
 		 710 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  27.41 
 
 		 710 aa  171  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  28.31 
 
 		 724 aa  155  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  33.21 
 
 		 1412 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  25.32 
 
 		 626 aa  124  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  27.02 
 
 		 677 aa  115  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  27.02 
 
 		 677 aa  115  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  27.64 
 
 		 607 aa  110  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  19.61 
 
 		 507 aa  44.3  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_222  Holliday junction DNA helicase  31.03 
 
 		 312 aa  43.9  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>