241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0570 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  76.65 
 
 
717 aa  1152    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  89.01 
 
 
710 aa  1322    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  100 
 
 
710 aa  1451    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  98.03 
 
 
710 aa  1431    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  98.87 
 
 
710 aa  1437    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  44.8 
 
 
672 aa  528  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  46.63 
 
 
676 aa  528  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  45.65 
 
 
676 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  45.98 
 
 
672 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  42.88 
 
 
674 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  45.07 
 
 
676 aa  515  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  43.57 
 
 
674 aa  515  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  42.98 
 
 
674 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  42.84 
 
 
674 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  46.31 
 
 
670 aa  492  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  40.59 
 
 
668 aa  452  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  40.17 
 
 
676 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  37.13 
 
 
724 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  36.94 
 
 
626 aa  339  9e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  31.62 
 
 
700 aa  328  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  37 
 
 
677 aa  320  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  37 
 
 
677 aa  320  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  33.29 
 
 
706 aa  318  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  32.32 
 
 
696 aa  318  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  33.33 
 
 
700 aa  316  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  31.83 
 
 
700 aa  313  6.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  30.19 
 
 
689 aa  308  3e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  32.85 
 
 
703 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  31.23 
 
 
717 aa  296  7e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  34.14 
 
 
693 aa  287  4e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  35.77 
 
 
607 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  31.55 
 
 
694 aa  267  5e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  32.03 
 
 
686 aa  266  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  32.1 
 
 
688 aa  261  2e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  28.16 
 
 
695 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  27.73 
 
 
682 aa  228  3e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  35.99 
 
 
873 aa  225  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  28.47 
 
 
680 aa  224  3e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  29.52 
 
 
679 aa  225  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  28.3 
 
 
680 aa  221  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  28.75 
 
 
882 aa  220  7e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  30.44 
 
 
686 aa  219  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  28.6 
 
 
761 aa  206  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  35.97 
 
 
458 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  28.23 
 
 
551 aa  197  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  26.07 
 
 
717 aa  196  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  33.33 
 
 
1059 aa  196  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  38.83 
 
 
1064 aa  195  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  33.49 
 
 
1412 aa  194  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  28.1 
 
 
755 aa  193  8e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  26.77 
 
 
811 aa  190  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  27.4 
 
 
729 aa  188  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  26.66 
 
 
717 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 
1342 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  29.57 
 
 
675 aa  184  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  25.98 
 
 
707 aa  181  5.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  24.53 
 
 
989 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  28.59 
 
 
848 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  27 
 
 
739 aa  177  8e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  27.21 
 
 
788 aa  177  8e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  27.72 
 
 
791 aa  175  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  25.81 
 
 
932 aa  173  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  32.04 
 
 
949 aa  172  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  26.21 
 
 
795 aa  173  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  27.41 
 
 
667 aa  172  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  29.56 
 
 
618 aa  172  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  28.57 
 
 
847 aa  170  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  25.53 
 
 
841 aa  170  8e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  26.2 
 
 
808 aa  168  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  29.51 
 
 
876 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  31.13 
 
 
963 aa  161  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  26.67 
 
 
796 aa  161  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  26.22 
 
 
890 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  25.63 
 
 
859 aa  160  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  25 
 
 
710 aa  157  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  26.38 
 
 
724 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  32.37 
 
 
709 aa  154  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  30.96 
 
 
915 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  27.68 
 
 
556 aa  148  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  29.83 
 
 
660 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  25 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  25.47 
 
 
467 aa  110  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  28.8 
 
 
501 aa  64.3  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  28 
 
 
512 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  29.14 
 
 
512 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.83 
 
 
618 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.06 
 
 
619 aa  58.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  28.66 
 
 
621 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  29.14 
 
 
512 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.88 
 
 
618 aa  56.2  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  26.43 
 
 
506 aa  56.6  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  28.57 
 
 
512 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  29.14 
 
 
512 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  25 
 
 
507 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  25 
 
 
507 aa  55.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.27 
 
 
620 aa  54.7  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  27.54 
 
 
506 aa  55.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  24.78 
 
 
513 aa  54.7  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  25.58 
 
 
510 aa  54.3  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0130  Mg chelatase-related protein  29.07 
 
 
298 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>