87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_75184 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  59.8 
 
 
556 aa  703    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  100 
 
 
882 aa  1816    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  47.82 
 
 
755 aa  676    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  49.04 
 
 
989 aa  855    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  45.19 
 
 
791 aa  610  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  39.9 
 
 
693 aa  424  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  40.84 
 
 
688 aa  398  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  34.34 
 
 
689 aa  382  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  35.62 
 
 
700 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  35.12 
 
 
700 aa  379  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  37.27 
 
 
695 aa  370  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  34.6 
 
 
729 aa  371  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  32.88 
 
 
686 aa  368  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  39.5 
 
 
841 aa  369  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  40.18 
 
 
679 aa  367  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  40.04 
 
 
811 aa  369  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  39.36 
 
 
682 aa  365  3e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  34.49 
 
 
700 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  40.18 
 
 
680 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  35.31 
 
 
694 aa  363  7.0000000000000005e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  34.38 
 
 
963 aa  363  7.0000000000000005e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  39.01 
 
 
680 aa  362  1e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  35.1 
 
 
706 aa  362  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  36.01 
 
 
717 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  39.69 
 
 
717 aa  353  5e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  37.52 
 
 
949 aa  351  3e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  33.94 
 
 
932 aa  350  8e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  40.3 
 
 
788 aa  349  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  40.38 
 
 
795 aa  348  3e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  32.67 
 
 
724 aa  347  5e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  38.83 
 
 
739 aa  346  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  39.09 
 
 
618 aa  345  2.9999999999999997e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  32.31 
 
 
696 aa  343  1e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  33.24 
 
 
686 aa  340  5.9999999999999996e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  37.21 
 
 
707 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  31.68 
 
 
703 aa  337  7.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  35.96 
 
 
808 aa  332  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  36.02 
 
 
796 aa  332  3e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  36.07 
 
 
667 aa  327  5e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  31.79 
 
 
848 aa  327  6e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  34.07 
 
 
876 aa  323  7e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  39.61 
 
 
551 aa  322  3e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  33.49 
 
 
847 aa  314  4.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  36.86 
 
 
660 aa  313  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  34.42 
 
 
859 aa  308  3e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  31.47 
 
 
890 aa  304  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  32.11 
 
 
709 aa  303  9e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  35.32 
 
 
915 aa  297  6e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  30.65 
 
 
761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  29.82 
 
 
676 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  31.1 
 
 
675 aa  250  8e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  38.98 
 
 
873 aa  246  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  29.3 
 
 
672 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  30.18 
 
 
668 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  36.39 
 
 
1059 aa  237  8e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  32.34 
 
 
674 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  31.54 
 
 
676 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  29.92 
 
 
676 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  30.08 
 
 
672 aa  235  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  31.69 
 
 
670 aa  233  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  32.02 
 
 
674 aa  233  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  32.21 
 
 
674 aa  233  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  32.2 
 
 
674 aa  232  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  29.01 
 
 
717 aa  231  5e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  29.44 
 
 
676 aa  230  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  29.69 
 
 
717 aa  226  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  28.31 
 
 
710 aa  224  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  35.99 
 
 
458 aa  224  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  28.91 
 
 
710 aa  221  6e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  28.75 
 
 
710 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  28.75 
 
 
710 aa  219  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  30.75 
 
 
487 aa  219  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  37.8 
 
 
1064 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
1342 aa  212  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  29.87 
 
 
724 aa  207  9e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  28.5 
 
 
710 aa  200  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  31.15 
 
 
467 aa  196  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  35.41 
 
 
1412 aa  173  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  28.92 
 
 
626 aa  171  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  28.25 
 
 
677 aa  145  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  28.25 
 
 
677 aa  145  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  28.07 
 
 
607 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  28.77 
 
 
508 aa  48.5  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  21.03 
 
 
514 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  27.37 
 
 
507 aa  45.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  26.29 
 
 
508 aa  45.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  19.73 
 
 
505 aa  44.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>