More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3421 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3940  Mg chelatase, subunit ChlI  73.37 
 
 		 508 aa  761    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4042  Mg chelatase, subunit ChlI  73.37 
 
 		 508 aa  764    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4016  Mg chelatase, subunit ChlI  72.98 
 
 		 508 aa  759    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  72.98 
 
 		 508 aa  762    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  71.43 
 
 		 506 aa  731    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  71.94 
 
 		 506 aa  750    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  100 
 
 		 506 aa  1028    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  73.82 
 
 		 509 aa  767    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  70.63 
 
 		 507 aa  739    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  73.18 
 
 		 508 aa  764    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  72.98 
 
 		 508 aa  761    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  75.35 
 
 		 507 aa  791    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  71.83 
 
 		 507 aa  746    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  73.18 
 
 		 508 aa  765    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4135  Mg chelatase, subunit ChlI  72.98 
 
 		 508 aa  761    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  71.79 
 
 		 508 aa  720    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  53.91 
 
 		 509 aa  548  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  53.68 
 
 		 509 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  54.33 
 
 		 508 aa  547  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  55.8 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  53.44 
 
 		 508 aa  543  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  53.54 
 
 		 507 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  53.54 
 
 		 507 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  53.44 
 
 		 508 aa  532  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  52.85 
 
 		 507 aa  535  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  54.04 
 
 		 508 aa  534  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  54.53 
 
 		 507 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  53.45 
 
 		 506 aa  531  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  54.13 
 
 		 507 aa  528  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  54.33 
 
 		 507 aa  527  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4033  Mg chelatase, subunit ChlI  52.86 
 
 		 508 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4133  putative ATP-dependent protease  50.89 
 
 		 506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.815544  normal  0.463834 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03644  predicted bifunctional enzyme and transcriptional regulator  50.88 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4209  Mg chelatase, subunit ChlI  50.98 
 
 		 506 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  50.69 
 
 		 506 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03593  hypothetical protein  50.88 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11947  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  51.97 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  51.77 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4236  putative ATP-dependent protease  50.59 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250822  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3983  putative ATP-dependent protease  50.59 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  50.89 
 
 		 506 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  51.57 
 
 		 506 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  51.77 
 
 		 506 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  51.77 
 
 		 506 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4153  putative ATP-dependent protease  50.69 
 
 		 506 aa  507  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0392  Mg chelatase, subunit ChlI  53.63 
 
 		 504 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  52.95 
 
 		 504 aa  502  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  54.13 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 510 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  49.21 
 
 		 505 aa  488  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  51.09 
 
 		 506 aa  482  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  51.9 
 
 		 497 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  52.41 
 
 		 497 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3653  Mg chelatase, subunit ChlI  49.8 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  50.3 
 
 		 496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  51.61 
 
 		 497 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  49.8 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  51.61 
 
 		 496 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  50.1 
 
 		 485 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  51.41 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  47.35 
 
 		 511 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  49.2 
 
 		 495 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  49.3 
 
 		 501 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  48.01 
 
 		 506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  51.61 
 
 		 496 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  47.49 
 
 		 516 aa  442  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  51.61 
 
 		 496 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  47.81 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0640  hypothetical protein  46.69 
 
 		 503 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  46.92 
 
 		 530 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  49.41 
 
 		 510 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  46.76 
 
 		 516 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  49.9 
 
 		 517 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  50.8 
 
 		 496 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0624  hypothetical protein  46.49 
 
 		 503 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  44.25 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  46.56 
 
 		 520 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  47.72 
 
 		 549 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  47.87 
 
 		 515 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  47.8 
 
 		 523 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  43.73 
 
 		 508 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  46.94 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  45.06 
 
 		 509 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0197  Mg chelatase-related protein  50.2 
 
 		 497 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  47.86 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  45.75 
 
 		 528 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  45.56 
 
 		 528 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0161  Mg chelatase, subunit ChlI  49.42 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  49.1 
 
 		 504 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  49.61 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.511309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  45.75 
 
 		 528 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  51.21 
 
 		 525 aa  418  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  45.56 
 
 		 528 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  45.56 
 
 		 528 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  46.49 
 
 		 526 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  43.45 
 
 		 511 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  47.88 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  49.8 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0082  Mg chelatase, subunit ChlI  50.4 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.361038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3316  Mg chelatase, subunit ChlI  49.51 
 
 		 569 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  0.0428603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>