More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0210 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0210  ATPase  100 
 
 
307 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_222  Holliday junction DNA helicase  86.14 
 
 
312 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.27 
 
 
345 aa  62.4  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0299  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.7 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.225929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  30 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1893  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.33 
 
 
340 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.4 
 
 
350 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1357  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.82 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1767  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.09 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  27 
 
 
341 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.212033 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  28.05 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_002978  WD1112  Holliday junction DNA helicase RuvB  31.94 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.729195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3609  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.82 
 
 
347 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.86 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.15 
 
 
368 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1215  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.7 
 
 
351 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.423128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.8 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.77 
 
 
352 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.302913  normal  0.384387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5229  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.12 
 
 
342 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_004310  BR1702  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.95 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1645  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.95 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.2 
 
 
339 aa  57  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0149  Holliday junction DNA helicase RuvB  30 
 
 
369 aa  57  0.0000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.63 
 
 
338 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0629  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.73 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.151039 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0319  Holliday junction DNA helicase RuvB  30.05 
 
 
329 aa  56.6  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.153675  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0731  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.19 
 
 
348 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0737  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.64 
 
 
340 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2637  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.93 
 
 
346 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.38 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3787  Holliday junction DNA helicase RuvB  31.14 
 
 
359 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.03 
 
 
355 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1213  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.95 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1251  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.16 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000492423  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.03 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.9 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  30.28 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.95 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1909  Holliday junction DNA helicase RuvB  34.64 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0928672  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf389  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.33 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.402154  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2652  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.51 
 
 
340 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2425  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.83 
 
 
347 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0049  Holliday junction DNA helicase RuvB  33.95 
 
 
332 aa  53.9  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.603347  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0922  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.36 
 
 
347 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0472532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.67 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2053  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.41 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0123486  normal  0.169016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1354  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.19 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00473129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2108  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.41 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4167  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.12 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165335  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.97 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2048  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.19 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1230  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.19 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0225142  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.69 
 
 
345 aa  53.5  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04040  ATPase, putative  26.55 
 
 
370 aa  53.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0684  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.91 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0676931  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0400  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.83 
 
 
340 aa  53.9  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1365  Holliday junction DNA helicase RuvB  25.97 
 
 
386 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191372  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1708  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.66 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.780962  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0162  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.18 
 
 
347 aa  53.1  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0835  Holliday junction DNA helicase RuvB  25.63 
 
 
375 aa  53.5  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0909626  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.88 
 
 
340 aa  53.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4803  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.12 
 
 
349 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  30.22 
 
 
338 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2515  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.84 
 
 
333 aa  53.1  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.75499  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.02 
 
 
338 aa  53.1  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.97 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  32.31 
 
 
335 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1008  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.3 
 
 
366 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000228051  hitchhiker  0.00140746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1104  Holliday junction DNA helicase RuvB  30.54 
 
 
348 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911797  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4269  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.27 
 
 
348 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812802  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.8 
 
 
344 aa  52.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.98 
 
 
366 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0582053 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0118  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.57 
 
 
348 aa  52.8  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0130464 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1192  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.06 
 
 
356 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0966  Holliday junction DNA helicase RuvB  30.99 
 
 
344 aa  52.4  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0751  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.98 
 
 
351 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.84 
 
 
338 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0786  Holliday junction DNA helicase RuvB  30.21 
 
 
348 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.48 
 
 
334 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20671  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.19 
 
 
356 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0953  Holliday junction DNA helicase RuvB  30.59 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1014  Holliday junction DNA helicase RuvB  30.59 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.67 
 
 
334 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0062  Holliday junction DNA helicase RuvB  31.18 
 
 
340 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2371  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.93 
 
 
339 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1011  Holliday junction DNA helicase RuvB  30.59 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0063  Holliday junction DNA helicase RuvB  31.18 
 
 
340 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.389593  normal  0.914826 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0172  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.14 
 
 
339 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.719394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2205  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.73 
 
 
343 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0335874  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0944  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.65 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.39 
 
 
348 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  26.67 
 
 
334 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.59 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3579  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.75 
 
 
360 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.16 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  25.96 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1883  Holliday junction DNA helicase RuvB  29.38 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  27.52 
 
 
336 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01559  Holliday junction DNA helicase RuvB  30.05 
 
 
345 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192423  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1642  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.69 
 
 
340 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000112926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>