More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf389 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf389  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 317 aa  634    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.402154  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0169  Holliday junction DNA helicase RuvB  43.97 
 
 		 324 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  42.81 
 
 		 338 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  39.87 
 
 		 341 aa  237  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.24 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.32 
 
 		 336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0684  Holliday junction DNA helicase RuvB  41.69 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0676931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0746  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.87 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2205  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.54 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0335874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.2 
 
 		 338 aa  232  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0737  Holliday junction DNA helicase RuvB  41.29 
 
 		 340 aa  231  9e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  40 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1324  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.91 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.211473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.54 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0319  Holliday junction DNA helicase RuvB  41.37 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.153675  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2371  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.25 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.821949 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0893  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.91 
 
 		 355 aa  230  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0248566  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2295  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.22 
 
 		 354 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.697474  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0606  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.13 
 
 		 349 aa  229  6e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.622406  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.24 
 
 		 354 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.24 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  41.2 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.33 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_545  Holliday junction DNA helicase subunit  40.13 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.48 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.24 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.56 
 
 		 354 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0580  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.13 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.990444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.24 
 
 		 356 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.87 
 
 		 351 aa  226  6e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.58 
 
 		 355 aa  225  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3316  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.96 
 
 		 337 aa  225  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0693  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.62 
 
 		 341 aa  225  9e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.418287  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl420  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.58 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.14232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.6 
 
 		 363 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1612  Holliday junction DNA helicase RuvB  41.5 
 
 		 334 aa  223  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1364  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.13 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0182  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.8 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.107724  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1554  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.81 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1534  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.07 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1630  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.6 
 
 		 347 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.952442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0499  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.91 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.456698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0868  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.27 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.281028  normal  0.0371389 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2173  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.46 
 
 		 338 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0384  Holliday junction DNA helicase RuvB  39 
 
 		 336 aa  222  6e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0184856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3694  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.58 
 
 		 356 aa  222  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500554  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2321  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.13 
 
 		 338 aa  222  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0801363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.07 
 
 		 337 aa  221  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.39 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1449  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.41 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0892  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.91 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0867495 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0575  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.91 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1203  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.66 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.54 
 
 		 344 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1678  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.94 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0966  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.6 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0152  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.83 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00761409  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1105  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.6 
 
 		 357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0530572  normal  0.598113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3181  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.6 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0287  Holliday junction DNA helicase RuvB  40.2 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2338  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.94 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.91 
 
 		 336 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.27 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.27 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0172  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.56 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.719394  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.58 
 
 		 354 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.69 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0559678  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0905  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.13 
 
 		 335 aa  219  6e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0373  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.76 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1362  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.25 
 
 		 344 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0922453  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0418  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.13 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1756  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.13 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.523828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3908  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.91 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1233  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.29 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0423  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.74 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110252 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1922  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.51 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.45 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1275  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.53 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.55 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.46 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  36.6 
 
 		 346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.95 
 
 		 352 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1452  Holliday junction DNA helicase RuvB  34.31 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467826  normal  0.361815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.25 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0786  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.26 
 
 		 348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756358  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2190  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.23 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000182664  normal  0.290064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.95 
 
 		 354 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0922  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.27 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0472532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.91 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2138  Holliday junction DNA helicase RuvB  34.41 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.58 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0133  Holliday junction DNA helicase RuvB  35.69 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526371  normal  0.412568 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.72 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0581  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.45 
 
 		 355 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.79 
 
 		 356 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.12 
 
 		 363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  37.58 
 
 		 346 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0607  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.45 
 
 		 354 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2696  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.12 
 
 		 355 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3690  Holliday junction DNA helicase RuvB  38.56 
 
 		 341 aa  215  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.212033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>