More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2515 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2515  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 333 aa  675    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.75499  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0049  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.98 
 
 		 332 aa  534  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.603347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1909  Holliday junction DNA helicase RuvB  77.92 
 
 		 318 aa  522  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0928672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0528  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.22 
 
 		 338 aa  435  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0415  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.51 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4505  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.09 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00121958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4315  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.09 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0417721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4650  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.09 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000830982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4554  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.09 
 
 		 333 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0578  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.38 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4153  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.78 
 
 		 336 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000576232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4164  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.78 
 
 		 336 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4539  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.78 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000348871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3137  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.78 
 
 		 333 aa  421  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000701371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4500  Holliday junction DNA helicase RuvA  63.78 
 
 		 541 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0696  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.78 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000306713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0612  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.64 
 
 		 351 aa  424  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4267  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.78 
 
 		 333 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000359024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.91 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.76 
 
 		 342 aa  414  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2521  Holliday junction DNA helicase RuvB  63.17 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1205  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.79 
 
 		 334 aa  408  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0781696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2034  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.72 
 
 		 338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0438556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.44 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1698  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.46 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1731  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.46 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.707795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 351 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.95 
 
 		 336 aa  398  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  60 
 
 		 345 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0376  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2719  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.23 
 
 		 347 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.66 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2203  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.06 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2571  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.011868  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0391  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.99 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1217  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.35 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1796  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  57.59 
 
 		 341 aa  391  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827733 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2419  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000499721  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1410  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.18 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.585511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.32 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1246  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.35 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2362  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.55 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00859369  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2303  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00841978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01270  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.49 
 
 		 340 aa  391  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1848  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.97 
 
 		 350 aa  391  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.9139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4541  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.54 
 
 		 352 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 		 337 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2044  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00121057  hitchhiker  0.0000000744022 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.75 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1902  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 334 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000022467  hitchhiker  0.0000432146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2076  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.5 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000131363  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2180  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.01 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729966  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51780  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.18 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3998  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.35 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.82 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2042  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.19 
 
 		 334 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000113724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.93 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1704  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.01 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0360063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  57.14 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36690  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.68 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2776  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.57 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00115584  normal  0.033156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.33 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.1 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2145  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.78 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4407  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.94 
 
 		 353 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.88 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.76 
 
 		 344 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1272  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.59 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197391  normal  0.338771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.18 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.62 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  57.14 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.52 
 
 		 335 aa  388  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4201  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.35 
 
 		 348 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.564106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0270  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.83 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1957  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.88 
 
 		 334 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0904224  normal  0.777155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 354 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1584  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0383381  normal  0.43268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1839  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.83 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.174268  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.71 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 336 aa  388  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.48 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1223  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.73 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.96 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.79 
 
 		 340 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.83 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2030  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.9 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959876  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1880  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.1 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00242586  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.86 
 
 		 355 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1939  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.94 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00566974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2143  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.9 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000101223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3625  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.13 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.14 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>