More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1237 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  100 
 
 		 506 aa  1030    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  46.43 
 
 		 498 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.38 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  43.67 
 
 		 509 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  45.68 
 
 		 509 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  44.24 
 
 		 489 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  41.64 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  39.45 
 
 		 547 aa  233  6e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.46 
 
 		 389 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  42.91 
 
 		 464 aa  230  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  41.82 
 
 		 546 aa  223  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  46.4 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  38.76 
 
 		 530 aa  219  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  36.9 
 
 		 553 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  37.54 
 
 		 560 aa  218  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  38.69 
 
 		 552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  36.9 
 
 		 553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  42.21 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  42.97 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  42.97 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  42.97 
 
 		 498 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  42.97 
 
 		 498 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  42.97 
 
 		 498 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  43.73 
 
 		 498 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  37.39 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.97 
 
 		 498 aa  207  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  42.97 
 
 		 506 aa  207  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  43.73 
 
 		 498 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  43.73 
 
 		 498 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  42.97 
 
 		 498 aa  206  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  43.73 
 
 		 498 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  41.46 
 
 		 498 aa  206  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  43.35 
 
 		 498 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  42.21 
 
 		 499 aa  206  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.13 
 
 		 526 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  42.21 
 
 		 499 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  43.14 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.39 
 
 		 528 aa  203  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  44.03 
 
 		 523 aa  202  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  42.97 
 
 		 499 aa  202  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  43.07 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  43.07 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  43.07 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.7 
 
 		 477 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.98 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.3 
 
 		 387 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  39.72 
 
 		 376 aa  173  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.44 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  35.63 
 
 		 390 aa  150  8e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.45 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  44.2 
 
 		 368 aa  146  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.41 
 
 		 383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  42.39 
 
 		 368 aa  140  6e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  42.53 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  41.85 
 
 		 368 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  37.44 
 
 		 379 aa  126  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  27.86 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2131  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.2 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.92 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  28.77 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  29.84 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  29.66 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  30.08 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  28.36 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  29.62 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  28.74 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  29.44 
 
 		 348 aa  72  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  28.38 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.48 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  29.46 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  28.91 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  28.16 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  28.85 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  28.85 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  28.85 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  31.39 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.16 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.64 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  28.5 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  28.46 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  30.05 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2965  ATPase  35.48 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.771332  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  27.65 
 
 		 309 aa  66.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.44 
 
 		 332 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.58 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.54 
 
 		 354 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.58 
 
 		 362 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  28.94 
 
 		 347 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  31.02 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.79 
 
 		 378 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  29.54 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.4 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  30.48 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  29.54 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  29.96 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  29.52 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  29.09 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  27.93 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3075  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0611881  decreased coverage  0.0000000372935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  25.61 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>