More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1492 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  87.88 
 
 		 620 aa  1053    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  86.96 
 
 		 621 aa  1056    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  87.86 
 
 		 618 aa  1063    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  79 
 
 		 619 aa  950    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  79.23 
 
 		 618 aa  963    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1630  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  88.98 
 
 		 619 aa  1075    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  100 
 
 		 618 aa  1243    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  48.41 
 
 		 636 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2540  magnesium chelatase ATPase subunit D  45.92 
 
 		 608 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2823  magnesium chelatase ATPase subunit D  44.59 
 
 		 610 aa  438  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00357294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4044  magnesium chelatase ATPase subunit D  35.83 
 
 		 671 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.653268 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.96 
 
 		 701 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4577  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.25 
 
 		 668 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2274  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.79 
 
 		 677 aa  364  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.29 
 
 		 725 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0799  magnesium chelatase ATPase subunit D  37.31 
 
 		 664 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38488  predicted protein  33.88 
 
 		 683 aa  361  2e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0236  magnesium chelatase ATPase subunit D  36.83 
 
 		 703 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.5 
 
 		 727 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  36.99 
 
 		 711 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03141  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  37.94 
 
 		 690 aa  343  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.421782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03681  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  39.34 
 
 		 717 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1654  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  39.34 
 
 		 717 aa  342  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.835262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3084  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36.21 
 
 		 678 aa  339  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  36.77 
 
 		 721 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25201  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  38.9 
 
 		 714 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.85 
 
 		 688 aa  299  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  31.98 
 
 		 680 aa  296  9e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2084  magnesium chelatase  34.38 
 
 		 617 aa  286  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191813  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1251  magnesium chelatase subunit D  34.8 
 
 		 599 aa  286  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045417 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  34.54 
 
 		 650 aa  286  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  31.84 
 
 		 669 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6448  magnesium chelatase subunit D  34.89 
 
 		 580 aa  280  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  32.18 
 
 		 614 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  32.27 
 
 		 660 aa  270  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  33.74 
 
 		 637 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  33.23 
 
 		 653 aa  267  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1694  magnesium chelatase subunit D  35.04 
 
 		 590 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0775219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4016  magnesium chelatase subunit D  36.32 
 
 		 586 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  32.34 
 
 		 619 aa  262  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  33.96 
 
 		 705 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3770  magnesium chelatase subunit D  35.2 
 
 		 588 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804805  normal  0.0156101 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  33.09 
 
 		 670 aa  251  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0486  magnesium chelatase subunit D  32.1 
 
 		 605 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0498  magnesium chelatase  32.97 
 
 		 612 aa  249  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.141561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  29.51 
 
 		 696 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  33.93 
 
 		 674 aa  241  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0750  magnesium chelatase subunit D/I family protein  29.8 
 
 		 643 aa  236  8e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.25 
 
 		 622 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.25 
 
 		 622 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.25 
 
 		 622 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  32.14 
 
 		 653 aa  233  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.54 
 
 		 665 aa  225  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  30.54 
 
 		 618 aa  224  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.19 
 
 		 673 aa  223  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3198  magnesium chelatase subunit D  33.65 
 
 		 614 aa  223  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  32.03 
 
 		 719 aa  221  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  30.78 
 
 		 674 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  30.27 
 
 		 638 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4967  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  40.79 
 
 		 672 aa  212  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  41.37 
 
 		 673 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  41.37 
 
 		 673 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  28.91 
 
 		 699 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3009  magnesium chelatase subunit D  33.28 
 
 		 582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.247156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2067  magnesium chelatase subunit D  31.27 
 
 		 587 aa  192  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.683367 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50740  predicted protein  35.74 
 
 		 800 aa  187  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0146  magnesium chelatase subunit D  31.7 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  27.91 
 
 		 594 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3503  magnesium chelatase subunit D  31.79 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457147  normal  0.553977 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2088  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.18 
 
 		 600 aa  182  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  36.36 
 
 		 372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  36.31 
 
 		 346 aa  177  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  38.04 
 
 		 340 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  35.02 
 
 		 364 aa  170  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  35.13 
 
 		 364 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  32.51 
 
 		 356 aa  169  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  34.6 
 
 		 637 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  32.76 
 
 		 309 aa  169  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  34.29 
 
 		 637 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  36.73 
 
 		 333 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  34.58 
 
 		 351 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  34.35 
 
 		 356 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1834  magnesium chelatase subunit D  31.89 
 
 		 566 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  37.71 
 
 		 342 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  37.64 
 
 		 337 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  37.64 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  34.06 
 
 		 347 aa  161  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  35.71 
 
 		 357 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  34.27 
 
 		 362 aa  160  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  33.64 
 
 		 362 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  35.56 
 
 		 344 aa  160  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  33.64 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  33.95 
 
 		 362 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  33.95 
 
 		 362 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  33.64 
 
 		 362 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  31.15 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  33.64 
 
 		 345 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  32.92 
 
 		 341 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  34.46 
 
 		 369 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  33.64 
 
 		 362 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>