240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1635 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  98.31 
 
 
710 aa  1435    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  100 
 
 
710 aa  1450    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  76.09 
 
 
717 aa  1149    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  89.01 
 
 
710 aa  1322    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  98.87 
 
 
710 aa  1437    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  46.47 
 
 
676 aa  527  1e-148  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  44.65 
 
 
672 aa  527  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  45.65 
 
 
676 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  43.02 
 
 
674 aa  522  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  45.81 
 
 
672 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  44.92 
 
 
676 aa  515  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  43.71 
 
 
674 aa  515  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  43.13 
 
 
674 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  42.99 
 
 
674 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  46.14 
 
 
670 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  40.03 
 
 
668 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  39.89 
 
 
676 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  36.85 
 
 
724 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  36.77 
 
 
626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  31.3 
 
 
700 aa  325  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  36.64 
 
 
677 aa  317  6e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  36.64 
 
 
677 aa  317  6e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  33.14 
 
 
706 aa  316  7e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  33.33 
 
 
700 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  32.32 
 
 
696 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  31.99 
 
 
700 aa  313  4.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  30.19 
 
 
689 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  32.7 
 
 
703 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  30 
 
 
717 aa  294  4e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  33.98 
 
 
693 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  35.96 
 
 
607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  31.23 
 
 
694 aa  265  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  31.62 
 
 
686 aa  263  6e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  32.42 
 
 
688 aa  261  3e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  28.02 
 
 
695 aa  244  3e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  27.41 
 
 
682 aa  225  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  29.48 
 
 
679 aa  225  3e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  35.73 
 
 
873 aa  223  9e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  27.88 
 
 
680 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  27.95 
 
 
680 aa  219  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  28.75 
 
 
882 aa  219  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  31.58 
 
 
686 aa  217  7e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  28.6 
 
 
761 aa  205  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  36.78 
 
 
458 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  39.16 
 
 
1064 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  26.07 
 
 
717 aa  196  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  28.06 
 
 
551 aa  194  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  33.08 
 
 
1059 aa  194  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  33.25 
 
 
1412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  27.94 
 
 
755 aa  190  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  26.27 
 
 
811 aa  190  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  27.02 
 
 
717 aa  189  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  27.4 
 
 
729 aa  187  8e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  35.4 
 
 
1342 aa  185  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  29.35 
 
 
675 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  26.1 
 
 
707 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  24.53 
 
 
989 aa  179  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  27.39 
 
 
788 aa  177  6e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  28.43 
 
 
848 aa  176  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  27 
 
 
739 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  28.01 
 
 
791 aa  174  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  26.39 
 
 
795 aa  173  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  25.81 
 
 
932 aa  172  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  29.72 
 
 
618 aa  172  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  27.41 
 
 
667 aa  171  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  31.77 
 
 
949 aa  171  6e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  25.53 
 
 
841 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  28.93 
 
 
847 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  26.2 
 
 
808 aa  168  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  29.8 
 
 
876 aa  167  8e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  26.85 
 
 
796 aa  161  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  26.22 
 
 
890 aa  160  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  25.63 
 
 
859 aa  160  9e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  30.85 
 
 
963 aa  160  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  25.88 
 
 
710 aa  157  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  26.38 
 
 
724 aa  154  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  32.37 
 
 
709 aa  153  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  30.96 
 
 
915 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  27.68 
 
 
556 aa  147  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  29.83 
 
 
660 aa  147  8.000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  25.56 
 
 
487 aa  132  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  25.28 
 
 
467 aa  110  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  28.8 
 
 
501 aa  64.3  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  28 
 
 
512 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.83 
 
 
618 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  29.14 
 
 
512 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.06 
 
 
619 aa  58.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  28.66 
 
 
621 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  29.14 
 
 
512 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  26.43 
 
 
506 aa  56.6  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  28.57 
 
 
512 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  29.14 
 
 
512 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  25 
 
 
507 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.88 
 
 
618 aa  55.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  25.22 
 
 
507 aa  55.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  27.54 
 
 
506 aa  55.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.27 
 
 
620 aa  54.7  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  24.78 
 
 
513 aa  54.7  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  25.58 
 
 
510 aa  54.3  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0130  Mg chelatase-related protein  29.07 
 
 
298 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>