119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0108 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  52.69 
 
 		 674 aa  736    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  61.76 
 
 		 676 aa  877    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  59.38 
 
 		 672 aa  837    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  53.97 
 
 		 676 aa  741    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  60.48 
 
 		 676 aa  868    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  60.86 
 
 		 676 aa  871    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  60.33 
 
 		 668 aa  862    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  100 
 
 		 670 aa  1373    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  52.54 
 
 		 674 aa  734    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  55.59 
 
 		 674 aa  765    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  54.55 
 
 		 674 aa  752    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  60.57 
 
 		 672 aa  863    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  46.47 
 
 		 710 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  46.31 
 
 		 710 aa  492  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  46.14 
 
 		 710 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  46.14 
 
 		 710 aa  488  1e-136  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  45.25 
 
 		 717 aa  481  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  36.66 
 
 		 724 aa  378  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  38.62 
 
 		 677 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  38.62 
 
 		 677 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  38.02 
 
 		 626 aa  372  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  37.5 
 
 		 607 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  31.3 
 
 		 700 aa  303  8.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  31.08 
 
 		 700 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  32.53 
 
 		 706 aa  292  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  33.12 
 
 		 693 aa  286  7e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  31.86 
 
 		 717 aa  282  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  32.25 
 
 		 703 aa  281  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  32.32 
 
 		 694 aa  281  4e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  35.08 
 
 		 686 aa  278  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  31.15 
 
 		 689 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  32.36 
 
 		 700 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  29.58 
 
 		 696 aa  258  4e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  31.26 
 
 		 688 aa  251  3e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  30.09 
 
 		 695 aa  249  9e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  33.91 
 
 		 680 aa  243  9e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  33.22 
 
 		 679 aa  242  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  34.08 
 
 		 682 aa  240  5e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  33.05 
 
 		 680 aa  234  5e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  31.69 
 
 		 882 aa  233  9e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  29.04 
 
 		 811 aa  228  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  31.68 
 
 		 686 aa  219  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  28.25 
 
 		 791 aa  216  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  29.22 
 
 		 717 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  27.13 
 
 		 667 aa  207  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  29.13 
 
 		 989 aa  206  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  34.42 
 
 		 873 aa  203  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  27.69 
 
 		 788 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  28.17 
 
 		 755 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  30.76 
 
 		 618 aa  200  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  27.83 
 
 		 675 aa  200  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  33.24 
 
 		 841 aa  198  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  26.94 
 
 		 739 aa  197  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  33.61 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  27.27 
 
 		 949 aa  194  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  28.21 
 
 		 710 aa  190  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  28.32 
 
 		 795 aa  189  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  26.83 
 
 		 729 aa  188  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  27.38 
 
 		 709 aa  187  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  27.82 
 
 		 848 aa  186  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  34.63 
 
 		 458 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  36.33 
 
 		 1059 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  28.52 
 
 		 796 aa  180  5.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  32.32 
 
 		 847 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  28.78 
 
 		 890 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  27.03 
 
 		 932 aa  179  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  27.63 
 
 		 724 aa  178  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  33.06 
 
 		 660 aa  177  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  32.68 
 
 		 963 aa  176  9e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  25.47 
 
 		 761 aa  176  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  27 
 
 		 808 aa  176  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  34.1 
 
 		 915 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  34.8 
 
 		 1412 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  26.78 
 
 		 859 aa  172  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  31.38 
 
 		 876 aa  172  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 1342 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  27.1 
 
 		 717 aa  171  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  36.03 
 
 		 1064 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  26.81 
 
 		 707 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1640  MCM family DNA replication protein  37.89 
 
 		 246 aa  165  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  28.76 
 
 		 556 aa  164  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  25.79 
 
 		 487 aa  124  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  30.31 
 
 		 467 aa  101  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  25.59 
 
 		 509 aa  51.2  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  25.77 
 
 		 638 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  22.31 
 
 		 501 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  22.79 
 
 		 512 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  22.99 
 
 		 506 aa  47.4  0.0009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  22.98 
 
 		 512 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_776  predicted protein  27.22 
 
 		 654 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  22.22 
 
 		 509 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  20.11 
 
 		 506 aa  47.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  22.47 
 
 		 507 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  21.78 
 
 		 508 aa  46.6  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  22.46 
 
 		 506 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1502  putative Mg chelatase-like protein  25.74 
 
 		 503 aa  46.6  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0158939  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  24.88 
 
 		 516 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  24.05 
 
 		 314 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.28 
 
 		 335 aa  45.8  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10400  Mg chelatase-related protein  23.91 
 
 		 497 aa  45.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000714945  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>